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Cluster: HRGMv2_3134_CGC9

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_3134_3 HRGMv2_3134_3_37 43956 45335 + 2.A.66.1.32
TF HRGMv2_3134_3 HRGMv2_3134_3_38 45389 45604 - 0043707
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_3134_3 HRGMv2_3134_3_39 45725 45898 + NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
TC HRGMv2_3134_3 HRGMv2_3134_3_40 46183 47520 + 3.D.6.1.2
TC HRGMv2_3134_3 HRGMv2_3134_3_41 47573 48532 + 3.D.6.1.2
TC HRGMv2_3134_3 HRGMv2_3134_3_42 48529 49083 + 3.D.6.1.2
TC HRGMv2_3134_3 HRGMv2_3134_3_43 49085 49783 + 3.D.6.1.2
TC HRGMv2_3134_3 HRGMv2_3134_3_44 49783 50400 + 3.D.6.1.2
TC HRGMv2_3134_3 HRGMv2_3134_3_45 50416 51207 + 3.D.6.1.2
TC HRGMv2_3134_3 HRGMv2_3134_3_46 51274 52635 - 2.A.66.1.32
pfam HRGMv2_3134_3 HRGMv2_3134_3_47 52792 53610 - AP_endonuc_2
pfam HRGMv2_3134_3 HRGMv2_3134_3_48 53628 54398 - PNP_UDP_1
CAZyme HRGMv2_3134_3 HRGMv2_3134_3_49 54478 57549 - GT39
CAZyme HRGMv2_3134_3 HRGMv2_3134_3_50 57719 60709 + GH2
Gene ID: HRGMv2_3134_3_37
Type: TC
Location: 43956 - 45335 (+)
Gene ID: HRGMv2_3134_3_38
Type: TF
Location: 45389 - 45604 (-)
Gene ID: HRGMv2_3134_3_39
Type:
Location: 45725 - 45898 (+)
Gene ID: HRGMv2_3134_3_40
Type: TC
Location: 46183 - 47520 (+)
Gene ID: HRGMv2_3134_3_41
Type: TC
Location: 47573 - 48532 (+)
Gene ID: HRGMv2_3134_3_42
Type: TC
Location: 48529 - 49083 (+)
Gene ID: HRGMv2_3134_3_43
Type: TC
Location: 49085 - 49783 (+)
Gene ID: HRGMv2_3134_3_44
Type: TC
Location: 49783 - 50400 (+)
Gene ID: HRGMv2_3134_3_45
Type: TC
Location: 50416 - 51207 (+)
Gene ID: HRGMv2_3134_3_46
Type: TC
Location: 51274 - 52635 (-)
Gene ID: HRGMv2_3134_3_47
Type: pfam
Location: 52792 - 53610 (-)
Gene ID: HRGMv2_3134_3_48
Type: pfam
Location: 53628 - 54398 (-)
Gene ID: HRGMv2_3134_3_49
Type: CAZyme
Location: 54478 - 57549 (-)
Gene ID: HRGMv2_3134_3_50
Type: CAZyme
Location: 57719 - 60709 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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