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Cluster: HRGMv2_3134_CGC39

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_3134_21 HRGMv2_3134_21_31 29645 31087 - 2.A.66.1.28
pfam HRGMv2_3134_21 HRGMv2_3134_21_32 31084 31395 - Dabb
CAZyme HRGMv2_3134_21 HRGMv2_3134_21_33 31535 32617 - GT2
pfam HRGMv2_3134_21 HRGMv2_3134_21_34 32689 34020 - Collagen | Collagen | Collagen | Collagen
CAZyme HRGMv2_3134_21 HRGMv2_3134_21_35 34265 35368 + GH179
pfam HRGMv2_3134_21 HRGMv2_3134_21_36 35419 36381 + URO-D
pfam HRGMv2_3134_21 HRGMv2_3134_21_37 36486 37847 - MatE | MatE
TC HRGMv2_3134_21 HRGMv2_3134_21_38 38062 38928 - 3.A.1.1.34
TC HRGMv2_3134_21 HRGMv2_3134_21_39 38936 39829 - 3.A.1.1.34
TC HRGMv2_3134_21 HRGMv2_3134_21_40 39933 41327 - 3.A.1.1.34
TC HRGMv2_3134_21 HRGMv2_3134_21_41 41806 42885 - 9.A.28.1.1
Gene ID: HRGMv2_3134_21_31
Type: TC
Location: 29645 - 31087 (-)
Gene ID: HRGMv2_3134_21_32
Type: pfam
Location: 31084 - 31395 (-)
Gene ID: HRGMv2_3134_21_33
Type: CAZyme
Location: 31535 - 32617 (-)
Gene ID: HRGMv2_3134_21_34
Type: pfam
Location: 32689 - 34020 (-)
Gene ID: HRGMv2_3134_21_35
Type: CAZyme
Location: 34265 - 35368 (+)
Gene ID: HRGMv2_3134_21_36
Type: pfam
Location: 35419 - 36381 (+)
Gene ID: HRGMv2_3134_21_37
Type: pfam
Location: 36486 - 37847 (-)
Gene ID: HRGMv2_3134_21_38
Type: TC
Location: 38062 - 38928 (-)
Gene ID: HRGMv2_3134_21_39
Type: TC
Location: 38936 - 39829 (-)
Gene ID: HRGMv2_3134_21_40
Type: TC
Location: 39933 - 41327 (-)
Gene ID: HRGMv2_3134_21_41
Type: TC
Location: 41806 - 42885 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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