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Cluster: HRGMv2_3117_CGC7

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_3117_21 HRGMv2_3117_21_5 6290 7624 + 3.D.6.1.2
TC HRGMv2_3117_21 HRGMv2_3117_21_6 7636 8631 + 3.D.6.1.2
TC HRGMv2_3117_21 HRGMv2_3117_21_7 8628 9194 + 3.D.6.1.3
TC HRGMv2_3117_21 HRGMv2_3117_21_8 9191 9856 + 3.D.6.1.2
TC HRGMv2_3117_21 HRGMv2_3117_21_9 9853 10440 + 3.D.6.1.2
TC HRGMv2_3117_21 HRGMv2_3117_21_10 10453 11301 + 3.D.6.1.2
TF HRGMv2_3117_21 HRGMv2_3117_21_11 11472 12170 + LytTR
STP HRGMv2_3117_21 HRGMv2_3117_21_12 12182 12844 + HATPase_c
TC HRGMv2_3117_21 HRGMv2_3117_21_13 12934 14757 + 3.A.1.111.2
TC HRGMv2_3117_21 HRGMv2_3117_21_14 14741 16627 + 3.A.1.111.2
STP HRGMv2_3117_21 HRGMv2_3117_21_15 16714 18054 + HD
pfam HRGMv2_3117_21 HRGMv2_3117_21_16 18204 19070 - DegV
CAZyme HRGMv2_3117_21 HRGMv2_3117_21_17 19629 21551 + GH13_9
pfam HRGMv2_3117_21 HRGMv2_3117_21_18 21651 22838 + Hexapep | NTP_transferase | NTP_transf_3 | Hexapep_GlmU
pfam HRGMv2_3117_21 HRGMv2_3117_21_19 22855 23970 + NTP_transferase | Hexapep_GlmU
CAZyme HRGMv2_3117_21 HRGMv2_3117_21_20 23967 25406 + GT5
CAZyme HRGMv2_3117_21 HRGMv2_3117_21_21 25512 27362 + GH13_39
Gene ID: HRGMv2_3117_21_5
Type: TC
Location: 6290 - 7624 (+)
Gene ID: HRGMv2_3117_21_6
Type: TC
Location: 7636 - 8631 (+)
Gene ID: HRGMv2_3117_21_7
Type: TC
Location: 8628 - 9194 (+)
Gene ID: HRGMv2_3117_21_8
Type: TC
Location: 9191 - 9856 (+)
Gene ID: HRGMv2_3117_21_9
Type: TC
Location: 9853 - 10440 (+)
Gene ID: HRGMv2_3117_21_10
Type: TC
Location: 10453 - 11301 (+)
Gene ID: HRGMv2_3117_21_11
Type: TF
Location: 11472 - 12170 (+)
Gene ID: HRGMv2_3117_21_12
Type: STP
Location: 12182 - 12844 (+)
Gene ID: HRGMv2_3117_21_13
Type: TC
Location: 12934 - 14757 (+)
Gene ID: HRGMv2_3117_21_14
Type: TC
Location: 14741 - 16627 (+)
Gene ID: HRGMv2_3117_21_15
Type: STP
Location: 16714 - 18054 (+)
Gene ID: HRGMv2_3117_21_16
Type: pfam
Location: 18204 - 19070 (-)
Gene ID: HRGMv2_3117_21_17
Type: CAZyme
Location: 19629 - 21551 (+)
Gene ID: HRGMv2_3117_21_18
Type: pfam
Location: 21651 - 22838 (+)
Gene ID: HRGMv2_3117_21_19
Type: pfam
Location: 22855 - 23970 (+)
Gene ID: HRGMv2_3117_21_20
Type: CAZyme
Location: 23967 - 25406 (+)
Gene ID: HRGMv2_3117_21_21
Type: CAZyme
Location: 25512 - 27362 (+)

Taxonomic Lineage

Domain
Bacteria
→
Phylum
Bacillota_A
→
Class
Clostridia
→
Order
Oscillospirales
→
Family
Oscillospiraceae
→
Genus
Faecousia
→

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_3117_21_12 vegetarian > omnivore 1.64822 0.02695
HRGMv2_3117_21_12 vegetarian > vegan 1.19442 0.00181

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