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Cluster: HRGMv2_3011_CGC4

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_3011_3 HRGMv2_3011_3_58 57737 58708 + GT2
pfam HRGMv2_3011_3 HRGMv2_3011_3_59 58728 59294 + dTDP_sugar_isom
CAZyme HRGMv2_3011_3 HRGMv2_3011_3_60 59297 60004 + GT2
pfam HRGMv2_3011_3 HRGMv2_3011_3_61 60009 61406 + Wzy_C
pfam HRGMv2_3011_3 HRGMv2_3011_3_62 61427 62830 + MatE | Polysacc_synt | Polysacc_synt_3
TC HRGMv2_3011_3 HRGMv2_3011_3_63 62968 63636 + 9.B.18.1.3
peptidase HRGMv2_3011_3 HRGMv2_3011_3_64 63777 64928 + S11.004
pfam HRGMv2_3011_3 HRGMv2_3011_3_65 64943 65671 + PseudoU_synth_2 | S4
TC HRGMv2_3011_3 HRGMv2_3011_3_66 65708 67036 + 3.B.1.1.2
pfam HRGMv2_3011_3 HRGMv2_3011_3_67 67056 67421 + Biotin_lipoyl | Biotin_lipoyl_2
TC HRGMv2_3011_3 HRGMv2_3011_3_68 67434 68837 + 3.B.1.1.6
pfam HRGMv2_3011_3 HRGMv2_3011_3_69 68899 69162 - Ribosomal_S20p
TC HRGMv2_3011_3 HRGMv2_3011_3_70 69241 70596 - 2.A.22.5.3
Gene ID: HRGMv2_3011_3_58
Type: CAZyme
Location: 57737 - 58708 (+)
Gene ID: HRGMv2_3011_3_59
Type: pfam
Location: 58728 - 59294 (+)
Gene ID: HRGMv2_3011_3_60
Type: CAZyme
Location: 59297 - 60004 (+)
Gene ID: HRGMv2_3011_3_61
Type: pfam
Location: 60009 - 61406 (+)
Gene ID: HRGMv2_3011_3_62
Type: pfam
Location: 61427 - 62830 (+)
Gene ID: HRGMv2_3011_3_63
Type: TC
Location: 62968 - 63636 (+)
Gene ID: HRGMv2_3011_3_64
Type: peptidase
Location: 63777 - 64928 (+)
Gene ID: HRGMv2_3011_3_65
Type: pfam
Location: 64943 - 65671 (+)
Gene ID: HRGMv2_3011_3_66
Type: TC
Location: 65708 - 67036 (+)
Gene ID: HRGMv2_3011_3_67
Type: pfam
Location: 67056 - 67421 (+)
Gene ID: HRGMv2_3011_3_68
Type: TC
Location: 67434 - 68837 (+)
Gene ID: HRGMv2_3011_3_69
Type: pfam
Location: 68899 - 69162 (-)
Gene ID: HRGMv2_3011_3_70
Type: TC
Location: 69241 - 70596 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

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