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Cluster: HRGMv2_2941_CGC5

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_2941_4 HRGMv2_2941_4_39 40764 41549 + CE4
pfam HRGMv2_2941_4 HRGMv2_2941_4_40 41598 42317 - DUF218
TC HRGMv2_2941_4 HRGMv2_2941_4_41 42310 44187 - 3.A.1.121.4
pfam HRGMv2_2941_4 HRGMv2_2941_4_42 44203 45492 - Transpeptidase
TC HRGMv2_2941_4 HRGMv2_2941_4_43 45489 47186 - 2.A.103.1.6
pfam HRGMv2_2941_4 HRGMv2_2941_4_44 47236 47646 + NusG_II
TC HRGMv2_2941_4 HRGMv2_2941_4_45 47639 48139 + 2.A.87.3.1
TC HRGMv2_2941_4 HRGMv2_2941_4_46 48186 49010 + 3.A.1.132.3
Gene ID: HRGMv2_2941_4_39
Type: CAZyme
Location: 40764 - 41549 (+)
Gene ID: HRGMv2_2941_4_40
Type: pfam
Location: 41598 - 42317 (-)
Gene ID: HRGMv2_2941_4_41
Type: TC
Location: 42310 - 44187 (-)
Gene ID: HRGMv2_2941_4_42
Type: pfam
Location: 44203 - 45492 (-)
Gene ID: HRGMv2_2941_4_43
Type: TC
Location: 45489 - 47186 (-)
Gene ID: HRGMv2_2941_4_44
Type: pfam
Location: 47236 - 47646 (+)
Gene ID: HRGMv2_2941_4_45
Type: TC
Location: 47639 - 48139 (+)
Gene ID: HRGMv2_2941_4_46
Type: TC
Location: 48186 - 49010 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_2941_4_43 vegetarian > vegan 1.72231 0.01054

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