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Cluster: HRGMv2_2935_CGC5

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2935_2 HRGMv2_2935_2_62 70852 71877 + 9.A.11.1.1
TC HRGMv2_2935_2 HRGMv2_2935_2_63 71891 72253 + 9.A.11.1.1
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_2935_2 HRGMv2_2935_2_64 72672 72893 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
CAZyme HRGMv2_2935_2 HRGMv2_2935_2_65 72967 75363 - GH94
CAZyme HRGMv2_2935_2 HRGMv2_2935_2_66 75688 76341 - GH25
TC HRGMv2_2935_2 HRGMv2_2935_2_67 76325 76765 - 1.E.19.1.10
sulfatase HRGMv2_2935_2 HRGMv2_2935_2_68 76809 77603 - S1_15
pfam HRGMv2_2935_2 HRGMv2_2935_2_69 77605 78900 - BppU_N
CAZyme HRGMv2_2935_2 HRGMv2_2935_2_70 79187 80707 - CBM6 | GH43_29
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_2935_2 HRGMv2_2935_2_71 80879 81193 + NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
peptidase HRGMv2_2935_2 HRGMv2_2935_2_72 81313 82839 + S16.UNW
CAZyme HRGMv2_2935_2 HRGMv2_2935_2_73 82976 85105 + GH3
pfam HRGMv2_2935_2 HRGMv2_2935_2_74 85276 86421 - FtsX | FtsX
TC HRGMv2_2935_2 HRGMv2_2935_2_75 86428 87120 - 3.A.1.122.7
STP HRGMv2_2935_2 HRGMv2_2935_2_76 87117 87695 - TetR_N
pfam HRGMv2_2935_2 HRGMv2_2935_2_77 88119 88541 + RNHCP
CAZyme HRGMv2_2935_2 HRGMv2_2935_2_78 88611 89816 + CBM22 | GH11
pfam HRGMv2_2935_2 HRGMv2_2935_2_79 89878 91050 - DnaJ | DnaJ_CXXCXGXG | DnaJ_C
TC HRGMv2_2935_2 HRGMv2_2935_2_80 91173 93020 - 1.A.33.1.4
Gene ID: HRGMv2_2935_2_62
Type: TC
Location: 70852 - 71877 (+)
Gene ID: HRGMv2_2935_2_63
Type: TC
Location: 71891 - 72253 (+)
Gene ID: HRGMv2_2935_2_64
Type:
Location: 72672 - 72893 (-)
Gene ID: HRGMv2_2935_2_65
Type: CAZyme
Location: 72967 - 75363 (-)
Gene ID: HRGMv2_2935_2_66
Type: CAZyme
Location: 75688 - 76341 (-)
Gene ID: HRGMv2_2935_2_67
Type: TC
Location: 76325 - 76765 (-)
Gene ID: HRGMv2_2935_2_68
Type: sulfatase
Location: 76809 - 77603 (-)
Gene ID: HRGMv2_2935_2_69
Type: pfam
Location: 77605 - 78900 (-)
Gene ID: HRGMv2_2935_2_70
Type: CAZyme
Location: 79187 - 80707 (-)
Gene ID: HRGMv2_2935_2_71
Type:
Location: 80879 - 81193 (+)
Gene ID: HRGMv2_2935_2_72
Type: peptidase
Location: 81313 - 82839 (+)
Gene ID: HRGMv2_2935_2_73
Type: CAZyme
Location: 82976 - 85105 (+)
Gene ID: HRGMv2_2935_2_74
Type: pfam
Location: 85276 - 86421 (-)
Gene ID: HRGMv2_2935_2_75
Type: TC
Location: 86428 - 87120 (-)
Gene ID: HRGMv2_2935_2_76
Type: STP
Location: 87117 - 87695 (-)
Gene ID: HRGMv2_2935_2_77
Type: pfam
Location: 88119 - 88541 (+)
Gene ID: HRGMv2_2935_2_78
Type: CAZyme
Location: 88611 - 89816 (+)
Gene ID: HRGMv2_2935_2_79
Type: pfam
Location: 89878 - 91050 (-)
Gene ID: HRGMv2_2935_2_80
Type: TC
Location: 91173 - 93020 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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