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Cluster: HRGMv2_2921_CGC3

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2921_3 HRGMv2_2921_3_51 62544 65162 - 3.A.3.2.21
CAZyme HRGMv2_2921_3 HRGMv2_2921_3_52 65456 66925 - CE4
TC HRGMv2_2921_3 HRGMv2_2921_3_53 67344 68054 - 3.A.1.4.10
TC HRGMv2_2921_3 HRGMv2_2921_3_54 68057 68818 - 3.A.1.4.10
TC HRGMv2_2921_3 HRGMv2_2921_3_55 68822 69799 - 3.A.1.4.10
TC HRGMv2_2921_3 HRGMv2_2921_3_56 69812 70693 - 3.A.1.4.10
TC HRGMv2_2921_3 HRGMv2_2921_3_57 70817 71998 - 3.A.1.4.10
TC HRGMv2_2921_3 HRGMv2_2921_3_58 72949 74601 - 3.A.1.5.2
TC HRGMv2_2921_3 HRGMv2_2921_3_59 74712 75680 - 3.A.1.5.20
TC HRGMv2_2921_3 HRGMv2_2921_3_60 75673 76695 - 3.A.1.5.41
TC HRGMv2_2921_3 HRGMv2_2921_3_61 76707 77765 - 3.A.1.5.2
TC HRGMv2_2921_3 HRGMv2_2921_3_62 77784 78701 - 3.A.1.5.2
STP HRGMv2_2921_3 HRGMv2_2921_3_63 79515 80018 - Sigma70_r4_2
TC HRGMv2_2921_3 HRGMv2_2921_3_64 80250 80726 - 4.A.1.1.1
TC HRGMv2_2921_3 HRGMv2_2921_3_65 80974 82425 - 4.A.1.1.7
TC HRGMv2_2921_3 HRGMv2_2921_3_66 82486 84135 - 8.A.7.1.1
Gene ID: HRGMv2_2921_3_51
Type: TC
Location: 62544 - 65162 (-)
Gene ID: HRGMv2_2921_3_52
Type: CAZyme
Location: 65456 - 66925 (-)
Gene ID: HRGMv2_2921_3_53
Type: TC
Location: 67344 - 68054 (-)
Gene ID: HRGMv2_2921_3_54
Type: TC
Location: 68057 - 68818 (-)
Gene ID: HRGMv2_2921_3_55
Type: TC
Location: 68822 - 69799 (-)
Gene ID: HRGMv2_2921_3_56
Type: TC
Location: 69812 - 70693 (-)
Gene ID: HRGMv2_2921_3_57
Type: TC
Location: 70817 - 71998 (-)
Gene ID: HRGMv2_2921_3_58
Type: TC
Location: 72949 - 74601 (-)
Gene ID: HRGMv2_2921_3_59
Type: TC
Location: 74712 - 75680 (-)
Gene ID: HRGMv2_2921_3_60
Type: TC
Location: 75673 - 76695 (-)
Gene ID: HRGMv2_2921_3_61
Type: TC
Location: 76707 - 77765 (-)
Gene ID: HRGMv2_2921_3_62
Type: TC
Location: 77784 - 78701 (-)
Gene ID: HRGMv2_2921_3_63
Type: STP
Location: 79515 - 80018 (-)
Gene ID: HRGMv2_2921_3_64
Type: TC
Location: 80250 - 80726 (-)
Gene ID: HRGMv2_2921_3_65
Type: TC
Location: 80974 - 82425 (-)
Gene ID: HRGMv2_2921_3_66
Type: TC
Location: 82486 - 84135 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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