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Cluster: HRGMv2_2832_CGC20

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_2832_31 HRGMv2_2832_31_4 3638 5572 - GH78
CAZyme HRGMv2_2832_31 HRGMv2_2832_31_5 5627 8002 - GH16
pfam HRGMv2_2832_31 HRGMv2_2832_31_6 8130 10649 - DUF5696
CAZyme HRGMv2_2832_31 HRGMv2_2832_31_7 10694 12421 - GH36
pfam HRGMv2_2832_31 HRGMv2_2832_31_8 12436 14544 - NHL | Yip1
TC HRGMv2_2832_31 HRGMv2_2832_31_9 14558 15418 - 3.A.1.1.48
TC HRGMv2_2832_31 HRGMv2_2832_31_10 15427 16320 - 3.A.1.1.4
STP HRGMv2_2832_31 HRGMv2_2832_31_11 16317 19094 - SBP_bac_1
TC HRGMv2_2832_31 HRGMv2_2832_31_12 19106 20008 - 3.A.1.1.36
TC HRGMv2_2832_31 HRGMv2_2832_31_13 20018 20932 - 3.A.1.1.11
CAZyme HRGMv2_2832_31 HRGMv2_2832_31_14 21018 22271 - GH16_3
Gene ID: HRGMv2_2832_31_4
Type: CAZyme
Location: 3638 - 5572 (-)
Gene ID: HRGMv2_2832_31_5
Type: CAZyme
Location: 5627 - 8002 (-)
Gene ID: HRGMv2_2832_31_6
Type: pfam
Location: 8130 - 10649 (-)
Gene ID: HRGMv2_2832_31_7
Type: CAZyme
Location: 10694 - 12421 (-)
Gene ID: HRGMv2_2832_31_8
Type: pfam
Location: 12436 - 14544 (-)
Gene ID: HRGMv2_2832_31_9
Type: TC
Location: 14558 - 15418 (-)
Gene ID: HRGMv2_2832_31_10
Type: TC
Location: 15427 - 16320 (-)
Gene ID: HRGMv2_2832_31_11
Type: STP
Location: 16317 - 19094 (-)
Gene ID: HRGMv2_2832_31_12
Type: TC
Location: 19106 - 20008 (-)
Gene ID: HRGMv2_2832_31_13
Type: TC
Location: 20018 - 20932 (-)
Gene ID: HRGMv2_2832_31_14
Type: CAZyme
Location: 21018 - 22271 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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