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Cluster: HRGMv2_2816_CGC11

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2816_10 HRGMv2_2816_10_55 66484 67935 - 2.A.66.1.33
pfam HRGMv2_2816_10 HRGMv2_2816_10_56 68203 69477 + Adenylsucc_synt
pfam HRGMv2_2816_10 HRGMv2_2816_10_57 69501 70919 + Lyase_1 | ADSL_C
TC HRGMv2_2816_10 HRGMv2_2816_10_58 71034 71840 - 3.A.1.15.14
TC HRGMv2_2816_10 HRGMv2_2816_10_59 71837 72553 - 3.A.1.15.8
TC HRGMv2_2816_10 HRGMv2_2816_10_60 72550 73536 - 3.A.1.15.3
TC HRGMv2_2816_10 HRGMv2_2816_10_61 73809 75545 - 2.A.58.2.2
TC HRGMv2_2816_10 HRGMv2_2816_10_62 75772 76563 + 3.A.1.3.28
TC HRGMv2_2816_10 HRGMv2_2816_10_63 76568 77215 + 3.A.1.3.14
TC HRGMv2_2816_10 HRGMv2_2816_10_64 77227 77985 + 3.A.1.3.10
STP HRGMv2_2816_10 HRGMv2_2816_10_65 78037 79554 - HATPase_c | HisKA
TF HRGMv2_2816_10 HRGMv2_2816_10_66 79551 80243 - Trans_reg_C
CAZyme HRGMv2_2816_10 HRGMv2_2816_10_67 80278 81540 - GT2
Gene ID: HRGMv2_2816_10_55
Type: TC
Location: 66484 - 67935 (-)
Gene ID: HRGMv2_2816_10_56
Type: pfam
Location: 68203 - 69477 (+)
Gene ID: HRGMv2_2816_10_57
Type: pfam
Location: 69501 - 70919 (+)
Gene ID: HRGMv2_2816_10_58
Type: TC
Location: 71034 - 71840 (-)
Gene ID: HRGMv2_2816_10_59
Type: TC
Location: 71837 - 72553 (-)
Gene ID: HRGMv2_2816_10_60
Type: TC
Location: 72550 - 73536 (-)
Gene ID: HRGMv2_2816_10_61
Type: TC
Location: 73809 - 75545 (-)
Gene ID: HRGMv2_2816_10_62
Type: TC
Location: 75772 - 76563 (+)
Gene ID: HRGMv2_2816_10_63
Type: TC
Location: 76568 - 77215 (+)
Gene ID: HRGMv2_2816_10_64
Type: TC
Location: 77227 - 77985 (+)
Gene ID: HRGMv2_2816_10_65
Type: STP
Location: 78037 - 79554 (-)
Gene ID: HRGMv2_2816_10_66
Type: TF
Location: 79551 - 80243 (-)
Gene ID: HRGMv2_2816_10_67
Type: CAZyme
Location: 80278 - 81540 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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