dbCAN Logo

Cluster: HRGMv2_2739_CGC5

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2739_6 HRGMv2_2739_6_50 33155 34348 + 3.A.1.1.22
TC HRGMv2_2739_6 HRGMv2_2739_6_51 34399 35769 - 2.A.66.1.33
pfam HRGMv2_2739_6 HRGMv2_2739_6_52 36013 36279 + SpoIIID
TC HRGMv2_2739_6 HRGMv2_2739_6_53 36541 37116 - 2.A.51.1.6
TC HRGMv2_2739_6 HRGMv2_2739_6_54 37113 37655 - 2.A.51.1.6
CAZyme HRGMv2_2739_6 HRGMv2_2739_6_55 38192 39130 - CE4
pfam HRGMv2_2739_6 HRGMv2_2739_6_56 39455 40717 + Enolase_C | Enolase_N | MR_MLE_C
TC HRGMv2_2739_6 HRGMv2_2739_6_57 40906 41811 - 1.A.35.3.2
pfam HRGMv2_2739_6 HRGMv2_2739_6_58 41874 42365 - Acetyltransf_1 | FR47 | Acetyltransf_3 | Acetyltransf_4 | Acetyltransf_7
STP HRGMv2_2739_6 HRGMv2_2739_6_59 43196 44671 + CBS | CBS
TC HRGMv2_2739_6 HRGMv2_2739_6_60 44815 46152 - 2.A.1.2.88
TC HRGMv2_2739_6 HRGMv2_2739_6_61 47043 47639 + 9.B.31.1.1
Gene ID: HRGMv2_2739_6_50
Type: TC
Location: 33155 - 34348 (+)
Gene ID: HRGMv2_2739_6_51
Type: TC
Location: 34399 - 35769 (-)
Gene ID: HRGMv2_2739_6_52
Type: pfam
Location: 36013 - 36279 (+)
Gene ID: HRGMv2_2739_6_53
Type: TC
Location: 36541 - 37116 (-)
Gene ID: HRGMv2_2739_6_54
Type: TC
Location: 37113 - 37655 (-)
Gene ID: HRGMv2_2739_6_55
Type: CAZyme
Location: 38192 - 39130 (-)
Gene ID: HRGMv2_2739_6_56
Type: pfam
Location: 39455 - 40717 (+)
Gene ID: HRGMv2_2739_6_57
Type: TC
Location: 40906 - 41811 (-)
Gene ID: HRGMv2_2739_6_58
Type: pfam
Location: 41874 - 42365 (-)
Gene ID: HRGMv2_2739_6_59
Type: STP
Location: 43196 - 44671 (+)
Gene ID: HRGMv2_2739_6_60
Type: TC
Location: 44815 - 46152 (-)
Gene ID: HRGMv2_2739_6_61
Type: TC
Location: 47043 - 47639 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

Loading chart...

No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

← Back to Cluster List