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Cluster: HRGMv2_2721_CGC14

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2721_11 HRGMv2_2721_11_6 4981 5637 + 9.B.18.1.2
CAZyme HRGMv2_2721_11 HRGMv2_2721_11_7 5656 6420 + GT111
pfam HRGMv2_2721_11 HRGMv2_2721_11_8 6424 7260 + LicD
pfam HRGMv2_2721_11 HRGMv2_2721_11_9 7257 7649 + CTP_transf_like
CAZyme HRGMv2_2721_11 HRGMv2_2721_11_10 7646 8638 + GT2
pfam HRGMv2_2721_11 HRGMv2_2721_11_11 8653 9855 + Wzy_C
TC HRGMv2_2721_11 HRGMv2_2721_11_12 9872 11416 + 2.A.66.1.40
pfam HRGMv2_2721_11 HRGMv2_2721_11_13 11406 12428 + Acyl_transf_3
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_2721_11 HRGMv2_2721_11_14 12471 14918 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
TC HRGMv2_2721_11 HRGMv2_2721_11_15 15258 16007 - 2.A.102.3.1
TC HRGMv2_2721_11 HRGMv2_2721_11_16 16308 17030 + 3.A.1.3.16
TC HRGMv2_2721_11 HRGMv2_2721_11_17 17100 18068 + 3.A.1.3.16
TC HRGMv2_2721_11 HRGMv2_2721_11_18 18182 18910 + 3.A.1.3.16
TC HRGMv2_2721_11 HRGMv2_2721_11_19 18907 19683 + 3.A.1.3.19
Gene ID: HRGMv2_2721_11_6
Type: TC
Location: 4981 - 5637 (+)
Gene ID: HRGMv2_2721_11_7
Type: CAZyme
Location: 5656 - 6420 (+)
Gene ID: HRGMv2_2721_11_8
Type: pfam
Location: 6424 - 7260 (+)
Gene ID: HRGMv2_2721_11_9
Type: pfam
Location: 7257 - 7649 (+)
Gene ID: HRGMv2_2721_11_10
Type: CAZyme
Location: 7646 - 8638 (+)
Gene ID: HRGMv2_2721_11_11
Type: pfam
Location: 8653 - 9855 (+)
Gene ID: HRGMv2_2721_11_12
Type: TC
Location: 9872 - 11416 (+)
Gene ID: HRGMv2_2721_11_13
Type: pfam
Location: 11406 - 12428 (+)
Gene ID: HRGMv2_2721_11_14
Type:
Location: 12471 - 14918 (-)
Gene ID: HRGMv2_2721_11_15
Type: TC
Location: 15258 - 16007 (-)
Gene ID: HRGMv2_2721_11_16
Type: TC
Location: 16308 - 17030 (+)
Gene ID: HRGMv2_2721_11_17
Type: TC
Location: 17100 - 18068 (+)
Gene ID: HRGMv2_2721_11_18
Type: TC
Location: 18182 - 18910 (+)
Gene ID: HRGMv2_2721_11_19
Type: TC
Location: 18907 - 19683 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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