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Cluster: HRGMv2_2635_CGC18

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_2635_11 HRGMv2_2635_11_72 73351 74250 - GT2
pfam HRGMv2_2635_11 HRGMv2_2635_11_73 74375 76006 + LytR_cpsA_psr | LytR_C
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_2635_11 HRGMv2_2635_11_74 76032 76694 + NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
TC HRGMv2_2635_11 HRGMv2_2635_11_75 76740 77477 + 2.A.102.2.7
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_2635_11 HRGMv2_2635_11_76 77981 79363 + NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_2635_11 HRGMv2_2635_11_77 79552 79824 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
TC HRGMv2_2635_11 HRGMv2_2635_11_78 79941 81260 + 2.A.42.2.1
pfam HRGMv2_2635_11 HRGMv2_2635_11_79 81318 81608 + YrhK
TC HRGMv2_2635_11 HRGMv2_2635_11_80 81866 83185 - 2.A.1.6.4
TC HRGMv2_2635_11 HRGMv2_2635_11_81 83586 84896 - 2.A.79.1.3
peptidase HRGMv2_2635_11 HRGMv2_2635_11_82 85316 86533 - M20.UPD
TC HRGMv2_2635_11 HRGMv2_2635_11_83 86793 87773 + 3.A.1.1.3
TC HRGMv2_2635_11 HRGMv2_2635_11_84 87780 88646 + 3.A.1.1.3
TC HRGMv2_2635_11 HRGMv2_2635_11_85 88729 90051 + 3.A.1.1.3
TC HRGMv2_2635_11 HRGMv2_2635_11_86 90096 91217 + 3.A.1.1.33
Gene ID: HRGMv2_2635_11_72
Type: CAZyme
Location: 73351 - 74250 (-)
Gene ID: HRGMv2_2635_11_73
Type: pfam
Location: 74375 - 76006 (+)
Gene ID: HRGMv2_2635_11_74
Type:
Location: 76032 - 76694 (+)
Gene ID: HRGMv2_2635_11_75
Type: TC
Location: 76740 - 77477 (+)
Gene ID: HRGMv2_2635_11_76
Type:
Location: 77981 - 79363 (+)
Gene ID: HRGMv2_2635_11_77
Type:
Location: 79552 - 79824 (-)
Gene ID: HRGMv2_2635_11_78
Type: TC
Location: 79941 - 81260 (+)
Gene ID: HRGMv2_2635_11_79
Type: pfam
Location: 81318 - 81608 (+)
Gene ID: HRGMv2_2635_11_80
Type: TC
Location: 81866 - 83185 (-)
Gene ID: HRGMv2_2635_11_81
Type: TC
Location: 83586 - 84896 (-)
Gene ID: HRGMv2_2635_11_82
Type: peptidase
Location: 85316 - 86533 (-)
Gene ID: HRGMv2_2635_11_83
Type: TC
Location: 86793 - 87773 (+)
Gene ID: HRGMv2_2635_11_84
Type: TC
Location: 87780 - 88646 (+)
Gene ID: HRGMv2_2635_11_85
Type: TC
Location: 88729 - 90051 (+)
Gene ID: HRGMv2_2635_11_86
Type: TC
Location: 90096 - 91217 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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