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Cluster: HRGMv2_2621_CGC19

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2621_15 HRGMv2_2621_15_16 15385 17478 - 3.A.1.132.3
TC HRGMv2_2621_15 HRGMv2_2621_15_17 17478 18638 - 3.A.1.132.1
pfam HRGMv2_2621_15 HRGMv2_2621_15_18 18762 19967 - MFS_1
TC HRGMv2_2621_15 HRGMv2_2621_15_19 20112 20885 - 3.A.1.34.1
TC HRGMv2_2621_15 HRGMv2_2621_15_20 20878 21768 - 3.A.1.34.1
pfam HRGMv2_2621_15 HRGMv2_2621_15_21 21856 22875 - ABC_sub_bind
sulfatase HRGMv2_2621_15 HRGMv2_2621_15_22 23284 25107 + S1_97
TC HRGMv2_2621_15 HRGMv2_2621_15_23 25175 26548 - 2.A.22.5.3
TC HRGMv2_2621_15 HRGMv2_2621_15_24 26634 28403 - 3.A.1.135.5
TC HRGMv2_2621_15 HRGMv2_2621_15_25 28400 30136 - 3.A.1.135.7
pfam HRGMv2_2621_15 HRGMv2_2621_15_26 30452 31855 + SLH | SLH | Peptidase_M15_4
CAZyme HRGMv2_2621_15 HRGMv2_2621_15_27 32244 35150 - GH38
TC HRGMv2_2621_15 HRGMv2_2621_15_28 35738 37177 + 2.A.3.7.2
peptidase HRGMv2_2621_15 HRGMv2_2621_15_29 37233 38558 + M18.UPW
TF HRGMv2_2621_15 HRGMv2_2621_15_30 38940 39722 - HTH_AraC
CAZyme HRGMv2_2621_15 HRGMv2_2621_15_31 39824 41650 + GH127
TC HRGMv2_2621_15 HRGMv2_2621_15_32 41773 42396 - 2.A.87.1.3
Gene ID: HRGMv2_2621_15_16
Type: TC
Location: 15385 - 17478 (-)
Gene ID: HRGMv2_2621_15_17
Type: TC
Location: 17478 - 18638 (-)
Gene ID: HRGMv2_2621_15_18
Type: pfam
Location: 18762 - 19967 (-)
Gene ID: HRGMv2_2621_15_19
Type: TC
Location: 20112 - 20885 (-)
Gene ID: HRGMv2_2621_15_20
Type: TC
Location: 20878 - 21768 (-)
Gene ID: HRGMv2_2621_15_21
Type: pfam
Location: 21856 - 22875 (-)
Gene ID: HRGMv2_2621_15_22
Type: sulfatase
Location: 23284 - 25107 (+)
Gene ID: HRGMv2_2621_15_23
Type: TC
Location: 25175 - 26548 (-)
Gene ID: HRGMv2_2621_15_24
Type: TC
Location: 26634 - 28403 (-)
Gene ID: HRGMv2_2621_15_25
Type: TC
Location: 28400 - 30136 (-)
Gene ID: HRGMv2_2621_15_26
Type: pfam
Location: 30452 - 31855 (+)
Gene ID: HRGMv2_2621_15_27
Type: CAZyme
Location: 32244 - 35150 (-)
Gene ID: HRGMv2_2621_15_28
Type: TC
Location: 35738 - 37177 (+)
Gene ID: HRGMv2_2621_15_29
Type: peptidase
Location: 37233 - 38558 (+)
Gene ID: HRGMv2_2621_15_30
Type: TF
Location: 38940 - 39722 (-)
Gene ID: HRGMv2_2621_15_31
Type: CAZyme
Location: 39824 - 41650 (+)
Gene ID: HRGMv2_2621_15_32
Type: TC
Location: 41773 - 42396 (-)

Taxonomic Lineage

Domain
Bacteria
→
Phylum
Bacillota_A
→
Class
Clostridia
→
Order
Monoglobales
→
Family
Monoglobaceae
→
Genus
Ructibacterium
→

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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