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Cluster: HRGMv2_2531_CGC2

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_2531_1 HRGMv2_2531_1_119 128785 130968 + GT51
CAZyme HRGMv2_2531_1 HRGMv2_2531_1_120 131136 139472 - GH20 | GH84
CAZyme HRGMv2_2531_1 HRGMv2_2531_1_121 139615 146187 - GH101
TC HRGMv2_2531_1 HRGMv2_2531_1_122 146483 148465 - 3.A.1.5.19
CAZyme HRGMv2_2531_1 HRGMv2_2531_1_123 148703 149758 - GT113
STP HRGMv2_2531_1 HRGMv2_2531_1_124 149783 150880 - Pyr_redox
TC HRGMv2_2531_1 HRGMv2_2531_1_125 150882 152306 - 2.A.66.2.16
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_2531_1 HRGMv2_2531_1_126 152456 153601 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
CAZyme HRGMv2_2531_1 HRGMv2_2531_1_127 153625 154590 - GT2
pfam HRGMv2_2531_1 HRGMv2_2531_1_128 154590 155684 - Epimerase_2
CAZyme HRGMv2_2531_1 HRGMv2_2531_1_129 155681 156766 - GT4
CAZyme HRGMv2_2531_1 HRGMv2_2531_1_130 156741 157436 - GT26
pfam HRGMv2_2531_1 HRGMv2_2531_1_131 157483 158268 - LicD
TC HRGMv2_2531_1 HRGMv2_2531_1_132 158273 159640 - 9.B.18.1.2
TC HRGMv2_2531_1 HRGMv2_2531_1_133 159663 160346 - 8.A.3.2.2
TC HRGMv2_2531_1 HRGMv2_2531_1_134 160356 161048 - 8.A.3.2.3
pfam HRGMv2_2531_1 HRGMv2_2531_1_135 161057 161788 - CpsB_CapC
pfam HRGMv2_2531_1 HRGMv2_2531_1_136 161790 163235 - DNA_PPF | LytR_cpsA_psr
TC HRGMv2_2531_1 HRGMv2_2531_1_137 163474 165432 - 3.A.1.5.19
CAZyme HRGMv2_2531_1 HRGMv2_2531_1_138 165630 167237 - GH13_31
pfam HRGMv2_2531_1 HRGMv2_2531_1_139 167390 168874 + DUF1846 | DUF1846_C
pfam HRGMv2_2531_1 HRGMv2_2531_1_140 168969 169451 + LuxS
TC HRGMv2_2531_1 HRGMv2_2531_1_141 169618 171723 - 3.A.9.1.2
Gene ID: HRGMv2_2531_1_119
Type: CAZyme
Location: 128785 - 130968 (+)
Gene ID: HRGMv2_2531_1_120
Type: CAZyme
Location: 131136 - 139472 (-)
Gene ID: HRGMv2_2531_1_121
Type: CAZyme
Location: 139615 - 146187 (-)
Gene ID: HRGMv2_2531_1_122
Type: TC
Location: 146483 - 148465 (-)
Gene ID: HRGMv2_2531_1_123
Type: CAZyme
Location: 148703 - 149758 (-)
Gene ID: HRGMv2_2531_1_124
Type: STP
Location: 149783 - 150880 (-)
Gene ID: HRGMv2_2531_1_125
Type: TC
Location: 150882 - 152306 (-)
Gene ID: HRGMv2_2531_1_126
Type:
Location: 152456 - 153601 (-)
Gene ID: HRGMv2_2531_1_127
Type: CAZyme
Location: 153625 - 154590 (-)
Gene ID: HRGMv2_2531_1_128
Type: pfam
Location: 154590 - 155684 (-)
Gene ID: HRGMv2_2531_1_129
Type: CAZyme
Location: 155681 - 156766 (-)
Gene ID: HRGMv2_2531_1_130
Type: CAZyme
Location: 156741 - 157436 (-)
Gene ID: HRGMv2_2531_1_131
Type: pfam
Location: 157483 - 158268 (-)
Gene ID: HRGMv2_2531_1_132
Type: TC
Location: 158273 - 159640 (-)
Gene ID: HRGMv2_2531_1_133
Type: TC
Location: 159663 - 160346 (-)
Gene ID: HRGMv2_2531_1_134
Type: TC
Location: 160356 - 161048 (-)
Gene ID: HRGMv2_2531_1_135
Type: pfam
Location: 161057 - 161788 (-)
Gene ID: HRGMv2_2531_1_136
Type: pfam
Location: 161790 - 163235 (-)
Gene ID: HRGMv2_2531_1_137
Type: TC
Location: 163474 - 165432 (-)
Gene ID: HRGMv2_2531_1_138
Type: CAZyme
Location: 165630 - 167237 (-)
Gene ID: HRGMv2_2531_1_139
Type: pfam
Location: 167390 - 168874 (+)
Gene ID: HRGMv2_2531_1_140
Type: pfam
Location: 168969 - 169451 (+)
Gene ID: HRGMv2_2531_1_141
Type: TC
Location: 169618 - 171723 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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