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Cluster: HRGMv2_2522_CGC4

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2522_1 HRGMv2_2522_1_365 374812 375732 + 9.B.126.2.5
pfam HRGMv2_2522_1 HRGMv2_2522_1_366 375749 376204 - GtrA_DPMS_TM
TC HRGMv2_2522_1 HRGMv2_2522_1_367 376386 376895 + 2.A.88.9.1
pfam HRGMv2_2522_1 HRGMv2_2522_1_368 377047 378993 + BRCT | DNA_ligase_aden | DNA_ligase_ZBD | DNA_ligase_OB | HHH_2 | HHH_5 | Nlig-Ia
pfam HRGMv2_2522_1 HRGMv2_2522_1_369 379005 380024 + DAGK_cat | NAD_kinase | YegS_C
CAZyme HRGMv2_2522_1 HRGMv2_2522_1_370 380028 382328 + CBM41 | GH13_14
CAZyme HRGMv2_2522_1 HRGMv2_2522_1_371 382534 384402 + CBM48 | GH13_9
pfam HRGMv2_2522_1 HRGMv2_2522_1_372 384444 385583 + NTP_transferase | NTP_transf_3 | Hexapep_GlmU
pfam HRGMv2_2522_1 HRGMv2_2522_1_373 385573 386706 + NTP_transferase | Hexapep_GlmU
CAZyme HRGMv2_2522_1 HRGMv2_2522_1_374 386703 388133 + GT5
pfam HRGMv2_2522_1 HRGMv2_2522_1_375 388465 388665 + ATP-synt_C
TC HRGMv2_2522_1 HRGMv2_2522_1_376 388698 389414 + 3.A.2.1.2
pfam HRGMv2_2522_1 HRGMv2_2522_1_377 389432 389929 + ATP-synt_B
pfam HRGMv2_2522_1 HRGMv2_2522_1_378 389929 390465 + OSCP
TC HRGMv2_2522_1 HRGMv2_2522_1_379 390481 391986 + 3.A.2.1.2
TC HRGMv2_2522_1 HRGMv2_2522_1_380 392002 392883 + 3.A.2.1.5
TC HRGMv2_2522_1 HRGMv2_2522_1_381 392957 394363 + 3.A.2.1.5
Gene ID: HRGMv2_2522_1_365
Type: TC
Location: 374812 - 375732 (+)
Gene ID: HRGMv2_2522_1_366
Type: pfam
Location: 375749 - 376204 (-)
Gene ID: HRGMv2_2522_1_367
Type: TC
Location: 376386 - 376895 (+)
Gene ID: HRGMv2_2522_1_368
Type: pfam
Location: 377047 - 378993 (+)
Gene ID: HRGMv2_2522_1_369
Type: pfam
Location: 379005 - 380024 (+)
Gene ID: HRGMv2_2522_1_370
Type: CAZyme
Location: 380028 - 382328 (+)
Gene ID: HRGMv2_2522_1_371
Type: CAZyme
Location: 382534 - 384402 (+)
Gene ID: HRGMv2_2522_1_372
Type: pfam
Location: 384444 - 385583 (+)
Gene ID: HRGMv2_2522_1_373
Type: pfam
Location: 385573 - 386706 (+)
Gene ID: HRGMv2_2522_1_374
Type: CAZyme
Location: 386703 - 388133 (+)
Gene ID: HRGMv2_2522_1_375
Type: pfam
Location: 388465 - 388665 (+)
Gene ID: HRGMv2_2522_1_376
Type: TC
Location: 388698 - 389414 (+)
Gene ID: HRGMv2_2522_1_377
Type: pfam
Location: 389432 - 389929 (+)
Gene ID: HRGMv2_2522_1_378
Type: pfam
Location: 389929 - 390465 (+)
Gene ID: HRGMv2_2522_1_379
Type: TC
Location: 390481 - 391986 (+)
Gene ID: HRGMv2_2522_1_380
Type: TC
Location: 392002 - 392883 (+)
Gene ID: HRGMv2_2522_1_381
Type: TC
Location: 392957 - 394363 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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