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Cluster: HRGMv2_2335_CGC33

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2335_41 HRGMv2_2335_41_15 14889 17756 + 3.A.3.5.15
TC HRGMv2_2335_41 HRGMv2_2335_41_16 18055 20655 + 3.A.9.1.2
pfam HRGMv2_2335_41 HRGMv2_2335_41_17 20749 20922 + DUF4250
pfam HRGMv2_2335_41 HRGMv2_2335_41_18 20915 22171 + RACo_C_ter | RACo_C_ter | Raco_middle
TC HRGMv2_2335_41 HRGMv2_2335_41_19 22275 24488 + 1.B.52.2.2
CAZyme HRGMv2_2335_41 HRGMv2_2335_41_20 24630 25358 + CE4
TF HRGMv2_2335_41 HRGMv2_2335_41_21 25562 26299 + LytTR
pfam HRGMv2_2335_41 HRGMv2_2335_41_22 26480 27004 + LemA
TC HRGMv2_2335_41 HRGMv2_2335_41_23 27194 28516 + 9.B.34.1.4
Gene ID: HRGMv2_2335_41_15
Type: TC
Location: 14889 - 17756 (+)
Gene ID: HRGMv2_2335_41_16
Type: TC
Location: 18055 - 20655 (+)
Gene ID: HRGMv2_2335_41_17
Type: pfam
Location: 20749 - 20922 (+)
Gene ID: HRGMv2_2335_41_18
Type: pfam
Location: 20915 - 22171 (+)
Gene ID: HRGMv2_2335_41_19
Type: TC
Location: 22275 - 24488 (+)
Gene ID: HRGMv2_2335_41_20
Type: CAZyme
Location: 24630 - 25358 (+)
Gene ID: HRGMv2_2335_41_21
Type: TF
Location: 25562 - 26299 (+)
Gene ID: HRGMv2_2335_41_22
Type: pfam
Location: 26480 - 27004 (+)
Gene ID: HRGMv2_2335_41_23
Type: TC
Location: 27194 - 28516 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_2335_41_21 vegetarian > omnivore 1.70038 0.00878

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