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Cluster: HRGMv2_2331_CGC9

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_2331_2 HRGMv2_2331_2_307 317144 318640 - GH77
TC HRGMv2_2331_2 HRGMv2_2331_2_308 318700 319560 - 3.A.1.1.45
TC HRGMv2_2331_2 HRGMv2_2331_2_309 319560 320600 - 3.A.1.1.45
STP HRGMv2_2331_2 HRGMv2_2331_2_310 320828 322192 - SBP_bac_1
CAZyme HRGMv2_2331_2 HRGMv2_2331_2_311 322249 323913 - GH13_31
TC HRGMv2_2331_2 HRGMv2_2331_2_312 324165 325277 + 3.A.1.1.26
pfam HRGMv2_2331_2 HRGMv2_2331_2_313 325346 326200 + HTH_30
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_2331_2 HRGMv2_2331_2_314 326193 326681 + NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
TC HRGMv2_2331_2 HRGMv2_2331_2_315 326743 328692 - 4.A.1.2.1
TC HRGMv2_2331_2 HRGMv2_2331_2_316 328946 330304 - 2.A.66.1.26
TC HRGMv2_2331_2 HRGMv2_2331_2_317 330561 333134 + 3.A.5.1.1
Gene ID: HRGMv2_2331_2_307
Type: CAZyme
Location: 317144 - 318640 (-)
Gene ID: HRGMv2_2331_2_308
Type: TC
Location: 318700 - 319560 (-)
Gene ID: HRGMv2_2331_2_309
Type: TC
Location: 319560 - 320600 (-)
Gene ID: HRGMv2_2331_2_310
Type: STP
Location: 320828 - 322192 (-)
Gene ID: HRGMv2_2331_2_311
Type: CAZyme
Location: 322249 - 323913 (-)
Gene ID: HRGMv2_2331_2_312
Type: TC
Location: 324165 - 325277 (+)
Gene ID: HRGMv2_2331_2_313
Type: pfam
Location: 325346 - 326200 (+)
Gene ID: HRGMv2_2331_2_314
Type:
Location: 326193 - 326681 (+)
Gene ID: HRGMv2_2331_2_315
Type: TC
Location: 326743 - 328692 (-)
Gene ID: HRGMv2_2331_2_316
Type: TC
Location: 328946 - 330304 (-)
Gene ID: HRGMv2_2331_2_317
Type: TC
Location: 330561 - 333134 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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