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Cluster: HRGMv2_2331_CGC2

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2331_1 HRGMv2_2331_1_154 168051 168320 + 8.A.8.1.5
TC HRGMv2_2331_1 HRGMv2_2331_1_155 168334 170058 + 8.A.7.1.1
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_2331_1 HRGMv2_2331_1_156 170052 171332 + NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
TC HRGMv2_2331_1 HRGMv2_2331_1_157 171336 172685 + 2.A.66.1.32
pfam HRGMv2_2331_1 HRGMv2_2331_1_158 173036 174109 + ABC_sub_bind
TC HRGMv2_2331_1 HRGMv2_2331_1_159 174118 175017 + 3.A.1.34.1
TC HRGMv2_2331_1 HRGMv2_2331_1_160 175004 175792 + 3.A.1.34.1
CAZyme HRGMv2_2331_1 HRGMv2_2331_1_161 175849 178812 - GT51
sulfatase HRGMv2_2331_1 HRGMv2_2331_1_162 178976 180811 - S1_97
TF HRGMv2_2331_1 HRGMv2_2331_1_163 180964 181335 + GntR
TC HRGMv2_2331_1 HRGMv2_2331_1_164 181332 182231 + 3.A.1.132.6
Gene ID: HRGMv2_2331_1_154
Type: TC
Location: 168051 - 168320 (+)
Gene ID: HRGMv2_2331_1_155
Type: TC
Location: 168334 - 170058 (+)
Gene ID: HRGMv2_2331_1_156
Type:
Location: 170052 - 171332 (+)
Gene ID: HRGMv2_2331_1_157
Type: TC
Location: 171336 - 172685 (+)
Gene ID: HRGMv2_2331_1_158
Type: pfam
Location: 173036 - 174109 (+)
Gene ID: HRGMv2_2331_1_159
Type: TC
Location: 174118 - 175017 (+)
Gene ID: HRGMv2_2331_1_160
Type: TC
Location: 175004 - 175792 (+)
Gene ID: HRGMv2_2331_1_161
Type: CAZyme
Location: 175849 - 178812 (-)
Gene ID: HRGMv2_2331_1_162
Type: sulfatase
Location: 178976 - 180811 (-)
Gene ID: HRGMv2_2331_1_163
Type: TF
Location: 180964 - 181335 (+)
Gene ID: HRGMv2_2331_1_164
Type: TC
Location: 181332 - 182231 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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