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Cluster: HRGMv2_2312_CGC22

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2312_11 HRGMv2_2312_11_32 18217 19587 + 3.A.1.1.11
TC HRGMv2_2312_11 HRGMv2_2312_11_33 19654 20562 + 3.A.1.1.11
TC HRGMv2_2312_11 HRGMv2_2312_11_34 20565 21422 + 3.A.1.1.11
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_2312_11 HRGMv2_2312_11_35 21429 23150 + NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
CAZyme HRGMv2_2312_11 HRGMv2_2312_11_36 23173 25113 + GH127
TC HRGMv2_2312_11 HRGMv2_2312_11_37 25294 26640 + 2.A.66.1.45
peptidase HRGMv2_2312_11 HRGMv2_2312_11_38 26731 27738 - M15.021
TC HRGMv2_2312_11 HRGMv2_2312_11_39 28331 29194 + 3.A.1.26.7
TC HRGMv2_2312_11 HRGMv2_2312_11_40 29211 30065 + 3.A.1.26.9
TC HRGMv2_2312_11 HRGMv2_2312_11_41 30105 30905 + 3.A.1.25.4
pfam HRGMv2_2312_11 HRGMv2_2312_11_42 30999 31763 + PseudoU_synth_1 | PseudoU_synth_1
CAZyme HRGMv2_2312_11 HRGMv2_2312_11_43 31851 33062 + GH105
Gene ID: HRGMv2_2312_11_32
Type: TC
Location: 18217 - 19587 (+)
Gene ID: HRGMv2_2312_11_33
Type: TC
Location: 19654 - 20562 (+)
Gene ID: HRGMv2_2312_11_34
Type: TC
Location: 20565 - 21422 (+)
Gene ID: HRGMv2_2312_11_35
Type:
Location: 21429 - 23150 (+)
Gene ID: HRGMv2_2312_11_36
Type: CAZyme
Location: 23173 - 25113 (+)
Gene ID: HRGMv2_2312_11_37
Type: TC
Location: 25294 - 26640 (+)
Gene ID: HRGMv2_2312_11_38
Type: peptidase
Location: 26731 - 27738 (-)
Gene ID: HRGMv2_2312_11_39
Type: TC
Location: 28331 - 29194 (+)
Gene ID: HRGMv2_2312_11_40
Type: TC
Location: 29211 - 30065 (+)
Gene ID: HRGMv2_2312_11_41
Type: TC
Location: 30105 - 30905 (+)
Gene ID: HRGMv2_2312_11_42
Type: pfam
Location: 30999 - 31763 (+)
Gene ID: HRGMv2_2312_11_43
Type: CAZyme
Location: 31851 - 33062 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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