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Cluster: HRGMv2_2302_CGC84

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2302_31 HRGMv2_2302_31_40 43598 44551 + 3.A.1.1.9
TC HRGMv2_2302_31 HRGMv2_2302_31_41 44570 45439 + 3.A.1.1.9
TC HRGMv2_2302_31 HRGMv2_2302_31_42 45547 47196 + 3.A.1.1.9
TC HRGMv2_2302_31 HRGMv2_2302_31_43 47320 49008 + 9.B.33.1.1
TF HRGMv2_2302_31 HRGMv2_2302_31_44 48989 49762 + HTH_AraC
pfam HRGMv2_2302_31 HRGMv2_2302_31_45 49861 50208 + PemK_toxin
TC HRGMv2_2302_31 HRGMv2_2302_31_46 50392 52071 + 8.A.59.2.1
TF HRGMv2_2302_31 HRGMv2_2302_31_47 52084 53529 + HTH_AraC | HTH_AraC
STP HRGMv2_2302_31 HRGMv2_2302_31_48 53612 55294 + SBP_bac_1
TC HRGMv2_2302_31 HRGMv2_2302_31_49 55422 56342 + 3.A.1.1.9
TC HRGMv2_2302_31 HRGMv2_2302_31_50 56351 57241 + 3.A.1.1.9
CAZyme HRGMv2_2302_31 HRGMv2_2302_31_51 57251 58363 + GH5_13
CAZyme HRGMv2_2302_31 HRGMv2_2302_31_52 58351 59895 + GH51_1
TC HRGMv2_2302_31 HRGMv2_2302_31_53 60651 61019 + 9.B.143.3.6
Gene ID: HRGMv2_2302_31_40
Type: TC
Location: 43598 - 44551 (+)
Gene ID: HRGMv2_2302_31_41
Type: TC
Location: 44570 - 45439 (+)
Gene ID: HRGMv2_2302_31_42
Type: TC
Location: 45547 - 47196 (+)
Gene ID: HRGMv2_2302_31_43
Type: TC
Location: 47320 - 49008 (+)
Gene ID: HRGMv2_2302_31_44
Type: TF
Location: 48989 - 49762 (+)
Gene ID: HRGMv2_2302_31_45
Type: pfam
Location: 49861 - 50208 (+)
Gene ID: HRGMv2_2302_31_46
Type: TC
Location: 50392 - 52071 (+)
Gene ID: HRGMv2_2302_31_47
Type: TF
Location: 52084 - 53529 (+)
Gene ID: HRGMv2_2302_31_48
Type: STP
Location: 53612 - 55294 (+)
Gene ID: HRGMv2_2302_31_49
Type: TC
Location: 55422 - 56342 (+)
Gene ID: HRGMv2_2302_31_50
Type: TC
Location: 56351 - 57241 (+)
Gene ID: HRGMv2_2302_31_51
Type: CAZyme
Location: 57251 - 58363 (+)
Gene ID: HRGMv2_2302_31_52
Type: CAZyme
Location: 58351 - 59895 (+)
Gene ID: HRGMv2_2302_31_53
Type: TC
Location: 60651 - 61019 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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