dbCAN Logo

Cluster: HRGMv2_2191_CGC28

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2191_31 HRGMv2_2191_31_4 6220 7728 + 3.A.1.2.3
TC HRGMv2_2191_31 HRGMv2_2191_31_5 7747 9402 + 3.A.1.2.3
TF HRGMv2_2191_31 HRGMv2_2191_31_6 9591 11201 + HTH_AraC | HTH_AraC
TC HRGMv2_2191_31 HRGMv2_2191_31_7 11191 13056 + 9.B.33.1.1
STP HRGMv2_2191_31 HRGMv2_2191_31_8 13046 14017 + Peripla_BP_1
TC HRGMv2_2191_31 HRGMv2_2191_31_9 14059 15099 + 3.A.1.2.3
TF HRGMv2_2191_31 HRGMv2_2191_31_10 15173 15949 - 0043707
CAZyme HRGMv2_2191_31 HRGMv2_2191_31_11 16177 18141 - GH127
TF HRGMv2_2191_31 HRGMv2_2191_31_12 18422 19222 + HTH_AraC | HTH_AraC
STP HRGMv2_2191_31 HRGMv2_2191_31_13 19403 19636 + FeoA
TC HRGMv2_2191_31 HRGMv2_2191_31_14 19629 21683 + 9.A.8.1.6
TF HRGMv2_2191_31 HRGMv2_2191_31_15 21688 22194 + HTH_11
TC HRGMv2_2191_31 HRGMv2_2191_31_16 22669 23244 + 3.A.2.1.5
TC HRGMv2_2191_31 HRGMv2_2191_31_17 23533 23754 + 3.A.2.1.5
pfam HRGMv2_2191_31 HRGMv2_2191_31_18 23804 24304 + ATP-synt_B
pfam HRGMv2_2191_31 HRGMv2_2191_31_19 24285 24788 + OSCP
TC HRGMv2_2191_31 HRGMv2_2191_31_20 24794 26305 + 3.A.2.1.5
TC HRGMv2_2191_31 HRGMv2_2191_31_21 26309 27199 + 3.A.2.1.5
TC HRGMv2_2191_31 HRGMv2_2191_31_22 27251 28648 + 3.A.2.1.5
Gene ID: HRGMv2_2191_31_4
Type: TC
Location: 6220 - 7728 (+)
Gene ID: HRGMv2_2191_31_5
Type: TC
Location: 7747 - 9402 (+)
Gene ID: HRGMv2_2191_31_6
Type: TF
Location: 9591 - 11201 (+)
Gene ID: HRGMv2_2191_31_7
Type: TC
Location: 11191 - 13056 (+)
Gene ID: HRGMv2_2191_31_8
Type: STP
Location: 13046 - 14017 (+)
Gene ID: HRGMv2_2191_31_9
Type: TC
Location: 14059 - 15099 (+)
Gene ID: HRGMv2_2191_31_10
Type: TF
Location: 15173 - 15949 (-)
Gene ID: HRGMv2_2191_31_11
Type: CAZyme
Location: 16177 - 18141 (-)
Gene ID: HRGMv2_2191_31_12
Type: TF
Location: 18422 - 19222 (+)
Gene ID: HRGMv2_2191_31_13
Type: STP
Location: 19403 - 19636 (+)
Gene ID: HRGMv2_2191_31_14
Type: TC
Location: 19629 - 21683 (+)
Gene ID: HRGMv2_2191_31_15
Type: TF
Location: 21688 - 22194 (+)
Gene ID: HRGMv2_2191_31_16
Type: TC
Location: 22669 - 23244 (+)
Gene ID: HRGMv2_2191_31_17
Type: TC
Location: 23533 - 23754 (+)
Gene ID: HRGMv2_2191_31_18
Type: pfam
Location: 23804 - 24304 (+)
Gene ID: HRGMv2_2191_31_19
Type: pfam
Location: 24285 - 24788 (+)
Gene ID: HRGMv2_2191_31_20
Type: TC
Location: 24794 - 26305 (+)
Gene ID: HRGMv2_2191_31_21
Type: TC
Location: 26309 - 27199 (+)
Gene ID: HRGMv2_2191_31_22
Type: TC
Location: 27251 - 28648 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

Loading chart...

Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_2191_31_17 vegan > omnivore 1.27979 0.00782
HRGMv2_2191_31_17 vegetarian > omnivore 1.19321 0.01882

🧭 Explore Read Mapping of CGC

← Back to Cluster List