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Cluster: HRGMv2_2191_CGC2

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_2191_1 HRGMv2_2191_1_98 89789 91933 - GH95
TC HRGMv2_2191_1 HRGMv2_2191_1_99 91997 93337 - 2.A.66.1.33
TC HRGMv2_2191_1 HRGMv2_2191_1_100 93616 94230 - 3.A.1.5.21
TC HRGMv2_2191_1 HRGMv2_2191_1_101 94291 95244 - 3.A.1.5.20
TC HRGMv2_2191_1 HRGMv2_2191_1_102 95274 96098 - 3.A.1.5.2
TC HRGMv2_2191_1 HRGMv2_2191_1_103 96095 97090 - 3.A.1.5.20
TC HRGMv2_2191_1 HRGMv2_2191_1_104 97170 98813 - 3.A.1.5.38
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_2191_1 HRGMv2_2191_1_105 98810 99061 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
pfam HRGMv2_2191_1 HRGMv2_2191_1_106 99101 100030 + VWA
TC HRGMv2_2191_1 HRGMv2_2191_1_107 100020 101393 - 2.A.66.1.32
Gene ID: HRGMv2_2191_1_98
Type: CAZyme
Location: 89789 - 91933 (-)
Gene ID: HRGMv2_2191_1_99
Type: TC
Location: 91997 - 93337 (-)
Gene ID: HRGMv2_2191_1_100
Type: TC
Location: 93616 - 94230 (-)
Gene ID: HRGMv2_2191_1_101
Type: TC
Location: 94291 - 95244 (-)
Gene ID: HRGMv2_2191_1_102
Type: TC
Location: 95274 - 96098 (-)
Gene ID: HRGMv2_2191_1_103
Type: TC
Location: 96095 - 97090 (-)
Gene ID: HRGMv2_2191_1_104
Type: TC
Location: 97170 - 98813 (-)
Gene ID: HRGMv2_2191_1_105
Type:
Location: 98810 - 99061 (-)
Gene ID: HRGMv2_2191_1_106
Type: pfam
Location: 99101 - 100030 (+)
Gene ID: HRGMv2_2191_1_107
Type: TC
Location: 100020 - 101393 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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