dbCAN Logo

Cluster: HRGMv2_2167_CGC15

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2167_1 HRGMv2_2167_1_3113 3429742 3430698 - 3.A.1.5.20
TC HRGMv2_2167_1 HRGMv2_2167_1_3114 3430698 3431702 - 3.A.1.5.20
TC HRGMv2_2167_1 HRGMv2_2167_1_3115 3431716 3432612 - 3.A.1.5.39
TC HRGMv2_2167_1 HRGMv2_2167_1_3116 3432625 3433557 - 3.A.1.5.11
TC HRGMv2_2167_1 HRGMv2_2167_1_3117 3433762 3435354 - 3.A.1.5.11
TF HRGMv2_2167_1 HRGMv2_2167_1_3118 3435622 3436509 - HTH_6
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_2167_1 HRGMv2_2167_1_3119 3436629 3436763 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
TC HRGMv2_2167_1 HRGMv2_2167_1_3120 3436796 3438391 - 3.A.1.5.11
TC HRGMv2_2167_1 HRGMv2_2167_1_3121 3438820 3440415 - 3.A.1.5.11
pfam HRGMv2_2167_1 HRGMv2_2167_1_3122 3440815 3443226 - tRNA-synt_1 | tRNA-synt_1 | Anticodon_1 | tRNA-synt_1g | tRNA-synt_1g | tRNA-synt_1_2
TC HRGMv2_2167_1 HRGMv2_2167_1_3123 3443933 3444691 + 2.A.102.3.1
CAZyme HRGMv2_2167_1 HRGMv2_2167_1_3124 3445035 3446054 - GT2
pfam HRGMv2_2167_1 HRGMv2_2167_1_3125 3446549 3447478 + AA_kinase
TC HRGMv2_2167_1 HRGMv2_2167_1_3126 3447827 3448621 - 3.D.6.1.2
TC HRGMv2_2167_1 HRGMv2_2167_1_3127 3448635 3449210 - 3.D.6.1.2
TC HRGMv2_2167_1 HRGMv2_2167_1_3128 3449226 3450059 - 3.D.6.1.2
TC HRGMv2_2167_1 HRGMv2_2167_1_3129 3450073 3450690 - 3.D.6.1.3
TC HRGMv2_2167_1 HRGMv2_2167_1_3130 3450677 3451621 - 3.D.6.1.2
TC HRGMv2_2167_1 HRGMv2_2167_1_3131 3451634 3452962 - 3.D.6.1.2
TC HRGMv2_2167_1 HRGMv2_2167_1_3132 3453327 3455207 - 3.A.1.135.5
TC HRGMv2_2167_1 HRGMv2_2167_1_3133 3455204 3457030 - 3.A.1.135.5
TC HRGMv2_2167_1 HRGMv2_2167_1_3134 3457023 3458372 - 2.A.66.1.33
Gene ID: HRGMv2_2167_1_3113
Type: TC
Location: 3429742 - 3430698 (-)
Gene ID: HRGMv2_2167_1_3114
Type: TC
Location: 3430698 - 3431702 (-)
Gene ID: HRGMv2_2167_1_3115
Type: TC
Location: 3431716 - 3432612 (-)
Gene ID: HRGMv2_2167_1_3116
Type: TC
Location: 3432625 - 3433557 (-)
Gene ID: HRGMv2_2167_1_3117
Type: TC
Location: 3433762 - 3435354 (-)
Gene ID: HRGMv2_2167_1_3118
Type: TF
Location: 3435622 - 3436509 (-)
Gene ID: HRGMv2_2167_1_3119
Type:
Location: 3436629 - 3436763 (-)
Gene ID: HRGMv2_2167_1_3120
Type: TC
Location: 3436796 - 3438391 (-)
Gene ID: HRGMv2_2167_1_3121
Type: TC
Location: 3438820 - 3440415 (-)
Gene ID: HRGMv2_2167_1_3122
Type: pfam
Location: 3440815 - 3443226 (-)
Gene ID: HRGMv2_2167_1_3123
Type: TC
Location: 3443933 - 3444691 (+)
Gene ID: HRGMv2_2167_1_3124
Type: CAZyme
Location: 3445035 - 3446054 (-)
Gene ID: HRGMv2_2167_1_3125
Type: pfam
Location: 3446549 - 3447478 (+)
Gene ID: HRGMv2_2167_1_3126
Type: TC
Location: 3447827 - 3448621 (-)
Gene ID: HRGMv2_2167_1_3127
Type: TC
Location: 3448635 - 3449210 (-)
Gene ID: HRGMv2_2167_1_3128
Type: TC
Location: 3449226 - 3450059 (-)
Gene ID: HRGMv2_2167_1_3129
Type: TC
Location: 3450073 - 3450690 (-)
Gene ID: HRGMv2_2167_1_3130
Type: TC
Location: 3450677 - 3451621 (-)
Gene ID: HRGMv2_2167_1_3131
Type: TC
Location: 3451634 - 3452962 (-)
Gene ID: HRGMv2_2167_1_3132
Type: TC
Location: 3453327 - 3455207 (-)
Gene ID: HRGMv2_2167_1_3133
Type: TC
Location: 3455204 - 3457030 (-)
Gene ID: HRGMv2_2167_1_3134
Type: TC
Location: 3457023 - 3458372 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

Loading chart...

No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

← Back to Cluster List