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Cluster: HRGMv2_2132_CGC34

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2132_31 HRGMv2_2132_31_40 56265 57671 - 2.A.22.5.3
STP HRGMv2_2132_31 HRGMv2_2132_31_41 57801 58577 - Nitro_FeMo-Co | Sigma70_r4_2
pfam HRGMv2_2132_31 HRGMv2_2132_31_42 58705 58998 - FakA-like_M
CAZyme HRGMv2_2132_31 HRGMv2_2132_31_43 59130 61631 - GH31_2
TC HRGMv2_2132_31 HRGMv2_2132_31_44 61786 63207 - 2.A.2.3.1
CAZyme HRGMv2_2132_31 HRGMv2_2132_31_45 63226 64026 - CE1
TF HRGMv2_2132_31 HRGMv2_2132_31_46 64243 65061 + HTH_AraC | HTH_AraC
peptidase HRGMv2_2132_31 HRGMv2_2132_31_47 65088 66098 + S09.UPW
TC HRGMv2_2132_31 HRGMv2_2132_31_48 66228 68330 + 1.B.52.2.1
CAZyme HRGMv2_2132_31 HRGMv2_2132_31_49 68425 70038 - CE20 | CE20
Gene ID: HRGMv2_2132_31_40
Type: TC
Location: 56265 - 57671 (-)
Gene ID: HRGMv2_2132_31_41
Type: STP
Location: 57801 - 58577 (-)
Gene ID: HRGMv2_2132_31_42
Type: pfam
Location: 58705 - 58998 (-)
Gene ID: HRGMv2_2132_31_43
Type: CAZyme
Location: 59130 - 61631 (-)
Gene ID: HRGMv2_2132_31_44
Type: TC
Location: 61786 - 63207 (-)
Gene ID: HRGMv2_2132_31_45
Type: CAZyme
Location: 63226 - 64026 (-)
Gene ID: HRGMv2_2132_31_46
Type: TF
Location: 64243 - 65061 (+)
Gene ID: HRGMv2_2132_31_47
Type: peptidase
Location: 65088 - 66098 (+)
Gene ID: HRGMv2_2132_31_48
Type: TC
Location: 66228 - 68330 (+)
Gene ID: HRGMv2_2132_31_49
Type: CAZyme
Location: 68425 - 70038 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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