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Cluster: HRGMv2_2042_CGC9

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2042_2 HRGMv2_2042_2_94 116870 118228 - 2.A.66.1.29
pfam HRGMv2_2042_2 HRGMv2_2042_2_95 118428 119678 + AAA_15 | AAA_21
pfam HRGMv2_2042_2 HRGMv2_2042_2_96 119665 120348 + HNH
TC HRGMv2_2042_2 HRGMv2_2042_2_97 120394 121050 + 2.A.115.2.12
TC HRGMv2_2042_2 HRGMv2_2042_2_98 121109 122320 - 8.A.59.4.2
TF HRGMv2_2042_2 HRGMv2_2042_2_99 122413 123189 - HTH_AraC | HTH_AraC
CAZyme HRGMv2_2042_2 HRGMv2_2042_2_100 123313 125700 + CBM67 | GH78
CAZyme HRGMv2_2042_2 HRGMv2_2042_2_101 125718 127163 + GH43_35
TC HRGMv2_2042_2 HRGMv2_2042_2_102 127174 128559 + 2.A.2.3.3
CAZyme HRGMv2_2042_2 HRGMv2_2042_2_103 128617 129690 + GH43_24
pfam HRGMv2_2042_2 HRGMv2_2042_2_104 129896 130999 + ROK
pfam HRGMv2_2042_2 HRGMv2_2042_2_105 131313 132341 + ADH_zinc_N | ADH_N | ADH_zinc_N_2
TC HRGMv2_2042_2 HRGMv2_2042_2_106 132374 133744 + 2.A.2.3.1
Gene ID: HRGMv2_2042_2_94
Type: TC
Location: 116870 - 118228 (-)
Gene ID: HRGMv2_2042_2_95
Type: pfam
Location: 118428 - 119678 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_2_96
Type: pfam
Location: 119665 - 120348 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_2_97
Type: TC
Location: 120394 - 121050 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_2_98
Type: TC
Location: 121109 - 122320 (-)
Gene ID: HRGMv2_2042_2_99
Type: TF
Location: 122413 - 123189 (-)
Gene ID: HRGMv2_2042_2_100
Type: CAZyme
Location: 123313 - 125700 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_2_101
Type: CAZyme
Location: 125718 - 127163 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_2_102
Type: TC
Location: 127174 - 128559 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_2_103
Type: CAZyme
Location: 128617 - 129690 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_2_104
Type: pfam
Location: 129896 - 130999 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_2_105
Type: pfam
Location: 131313 - 132341 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_2_106
Type: TC
Location: 132374 - 133744 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_2042_2_97 vegetarian > omnivore 1.29993 0.02781
HRGMv2_2042_2_104 vegan > omnivore 1.68301 0.02487

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