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Cluster: HRGMv2_2042_CGC3

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2042_1 HRGMv2_2042_1_95 107077 108507 + 2.A.38.1.1
TC HRGMv2_2042_1 HRGMv2_2042_1_96 108523 109965 + 2.A.38.1.1
STP HRGMv2_2042_1 HRGMv2_2042_1_97 110127 111206 + Aminotran_1_2
TC HRGMv2_2042_1 HRGMv2_2042_1_98 111367 112743 + 2.A.66.1.33
STP HRGMv2_2042_1 HRGMv2_2042_1_99 112827 113114 + PTS-HPr
pfam HRGMv2_2042_1 HRGMv2_2042_1_100 113347 113547 + SASP
CAZyme HRGMv2_2042_1 HRGMv2_2042_1_101 113750 114553 + CE1
peptidase HRGMv2_2042_1 HRGMv2_2042_1_102 114645 115916 - S09.UPD
pfam HRGMv2_2042_1 HRGMv2_2042_1_103 116457 117920 + Abhydrolase_10
CAZyme HRGMv2_2042_1 HRGMv2_2042_1_104 118067 119680 + GH140
pfam HRGMv2_2042_1 HRGMv2_2042_1_105 119847 121397 + DUF3502
TC HRGMv2_2042_1 HRGMv2_2042_1_106 121534 122472 + 3.A.1.1.10
TC HRGMv2_2042_1 HRGMv2_2042_1_107 122483 123382 + 3.A.1.1.29
Gene ID: HRGMv2_2042_1_95
Type: TC
Location: 107077 - 108507 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_1_96
Type: TC
Location: 108523 - 109965 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_1_97
Type: STP
Location: 110127 - 111206 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_1_98
Type: TC
Location: 111367 - 112743 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_1_99
Type: STP
Location: 112827 - 113114 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_1_100
Type: pfam
Location: 113347 - 113547 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_1_101
Type: CAZyme
Location: 113750 - 114553 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_1_102
Type: peptidase
Location: 114645 - 115916 (-)
Gene ID: HRGMv2_2042_1_103
Type: pfam
Location: 116457 - 117920 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_1_104
Type: CAZyme
Location: 118067 - 119680 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_1_105
Type: pfam
Location: 119847 - 121397 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_1_106
Type: TC
Location: 121534 - 122472 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_1_107
Type: TC
Location: 122483 - 123382 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_2042_1_101 vegan > omnivore 2.04541 0.02487
HRGMv2_2042_1_101 vegetarian > omnivore 2.07936 0.01877

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