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Cluster: HRGMv2_2042_CGC27

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2042_19 HRGMv2_2042_19_30 30053 31450 + 2.A.35.2.1
pfam HRGMv2_2042_19 HRGMv2_2042_19_31 31522 31923 - ATP-synt_DE | ATP-synt_DE_N
TC HRGMv2_2042_19 HRGMv2_2042_19_32 31938 33338 - 3.A.2.1.5
TC HRGMv2_2042_19 HRGMv2_2042_19_33 33374 34240 - 3.A.2.1.5
TC HRGMv2_2042_19 HRGMv2_2042_19_34 34259 35788 - 3.A.2.1.5
pfam HRGMv2_2042_19 HRGMv2_2042_19_35 35798 36337 - OSCP
pfam HRGMv2_2042_19 HRGMv2_2042_19_36 36334 36837 - ATP-synt_B
TC HRGMv2_2042_19 HRGMv2_2042_19_37 36875 37153 - 3.A.2.1.2
TC HRGMv2_2042_19 HRGMv2_2042_19_38 37205 37966 - 3.A.2.1.5
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_2042_19 HRGMv2_2042_19_39 38133 38555 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
pfam HRGMv2_2042_19 HRGMv2_2042_19_40 38660 38944 - ATPase_gene1
CAZyme HRGMv2_2042_19 HRGMv2_2042_19_41 39260 42040 - CBM67 | GH78
Gene ID: HRGMv2_2042_19_30
Type: TC
Location: 30053 - 31450 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_19_31
Type: pfam
Location: 31522 - 31923 (-)
Gene ID: HRGMv2_2042_19_32
Type: TC
Location: 31938 - 33338 (-)
Gene ID: HRGMv2_2042_19_33
Type: TC
Location: 33374 - 34240 (-)
Gene ID: HRGMv2_2042_19_34
Type: TC
Location: 34259 - 35788 (-)
Gene ID: HRGMv2_2042_19_35
Type: pfam
Location: 35798 - 36337 (-)
Gene ID: HRGMv2_2042_19_36
Type: pfam
Location: 36334 - 36837 (-)
Gene ID: HRGMv2_2042_19_37
Type: TC
Location: 36875 - 37153 (-)
Gene ID: HRGMv2_2042_19_38
Type: TC
Location: 37205 - 37966 (-)
Gene ID: HRGMv2_2042_19_39
Type:
Location: 38133 - 38555 (-)
Gene ID: HRGMv2_2042_19_40
Type: pfam
Location: 38660 - 38944 (-)
Gene ID: HRGMv2_2042_19_41
Type: CAZyme
Location: 39260 - 42040 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_2042_19_37 vegan > omnivore 1.14198 0.01287

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