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Cluster: HRGMv2_2042_CGC2

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_2042_1 HRGMv2_2042_1_77 79669 81459 + 3.A.1.117.1
STP HRGMv2_2042_1 HRGMv2_2042_1_78 81747 83270 + SBP_bac_1
TC HRGMv2_2042_1 HRGMv2_2042_1_79 83421 84359 + 3.A.1.1.10
TC HRGMv2_2042_1 HRGMv2_2042_1_80 84372 85274 + 3.A.1.1.29
TC HRGMv2_2042_1 HRGMv2_2042_1_81 85466 87208 + 9.B.33.1.1
TF HRGMv2_2042_1 HRGMv2_2042_1_82 87186 88781 + 0035607 | 0036286
CAZyme HRGMv2_2042_1 HRGMv2_2042_1_83 88968 91187 + GH3
TC HRGMv2_2042_1 HRGMv2_2042_1_84 91386 92756 + 2.A.66.1.45
CAZyme HRGMv2_2042_1 HRGMv2_2042_1_85 92874 94181 + GH29
TC HRGMv2_2042_1 HRGMv2_2042_1_86 94624 95349 + 3.A.1.147.8
Gene ID: HRGMv2_2042_1_77
Type: TC
Location: 79669 - 81459 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_1_78
Type: STP
Location: 81747 - 83270 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_1_79
Type: TC
Location: 83421 - 84359 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_1_80
Type: TC
Location: 84372 - 85274 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_1_81
Type: TC
Location: 85466 - 87208 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_1_82
Type: TF
Location: 87186 - 88781 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_1_83
Type: CAZyme
Location: 88968 - 91187 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_1_84
Type: TC
Location: 91386 - 92756 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_1_85
Type: CAZyme
Location: 92874 - 94181 (+)
Gene ID: HRGMv2_2042_1_86
Type: TC
Location: 94624 - 95349 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

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