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Cluster: HRGMv2_2011_CGC9

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_2011_7 HRGMv2_2011_7_64 60663 61301 - GH23
pfam HRGMv2_2011_7 HRGMv2_2011_7_65 61595 62398 + PNP_UDP_1
pfam HRGMv2_2011_7 HRGMv2_2011_7_66 62413 62682 + YGGT
TC HRGMv2_2011_7 HRGMv2_2011_7_67 62728 64068 + 2.A.38.1.1
TC HRGMv2_2011_7 HRGMv2_2011_7_68 64070 65542 + 2.A.38.1.1
pfam HRGMv2_2011_7 HRGMv2_2011_7_69 65646 67097 + OEP | OEP
TC HRGMv2_2011_7 HRGMv2_2011_7_70 67097 68266 + 8.A.1.6.2
TC HRGMv2_2011_7 HRGMv2_2011_7_71 68266 68958 + 3.A.1.122.2
TC HRGMv2_2011_7 HRGMv2_2011_7_72 68955 70184 + 3.A.1.122.2
Gene ID: HRGMv2_2011_7_64
Type: CAZyme
Location: 60663 - 61301 (-)
Gene ID: HRGMv2_2011_7_65
Type: pfam
Location: 61595 - 62398 (+)
Gene ID: HRGMv2_2011_7_66
Type: pfam
Location: 62413 - 62682 (+)
Gene ID: HRGMv2_2011_7_67
Type: TC
Location: 62728 - 64068 (+)
Gene ID: HRGMv2_2011_7_68
Type: TC
Location: 64070 - 65542 (+)
Gene ID: HRGMv2_2011_7_69
Type: pfam
Location: 65646 - 67097 (+)
Gene ID: HRGMv2_2011_7_70
Type: TC
Location: 67097 - 68266 (+)
Gene ID: HRGMv2_2011_7_71
Type: TC
Location: 68266 - 68958 (+)
Gene ID: HRGMv2_2011_7_72
Type: TC
Location: 68955 - 70184 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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