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Cluster: HRGMv2_1971_CGC14

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_1971_4 HRGMv2_1971_4_36 38503 39153 - GH23
pfam HRGMv2_1971_4 HRGMv2_1971_4_37 39469 40272 + PNP_UDP_1
TC HRGMv2_1971_4 HRGMv2_1971_4_38 40291 40560 + 9.A.4.2.3
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_1971_4 HRGMv2_1971_4_39 40578 41546 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
TC HRGMv2_1971_4 HRGMv2_1971_4_40 41632 42972 + 2.A.38.1.1
TC HRGMv2_1971_4 HRGMv2_1971_4_41 42974 44431 + 2.A.38.1.1
TC HRGMv2_1971_4 HRGMv2_1971_4_42 44524 45975 + 1.B.17.2.5
TC HRGMv2_1971_4 HRGMv2_1971_4_43 45972 47159 + 8.A.1.6.2
TC HRGMv2_1971_4 HRGMv2_1971_4_44 47197 47901 + 3.A.1.122.2
TC HRGMv2_1971_4 HRGMv2_1971_4_45 48023 49249 + 3.A.1.122.2
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_1971_4 HRGMv2_1971_4_46 49312 50040 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
pfam HRGMv2_1971_4 HRGMv2_1971_4_47 50224 50571 - DUF6812
TC HRGMv2_1971_4 HRGMv2_1971_4_48 50639 51514 - 2.A.115.1.2
Gene ID: HRGMv2_1971_4_36
Type: CAZyme
Location: 38503 - 39153 (-)
Gene ID: HRGMv2_1971_4_37
Type: pfam
Location: 39469 - 40272 (+)
Gene ID: HRGMv2_1971_4_38
Type: TC
Location: 40291 - 40560 (+)
Gene ID: HRGMv2_1971_4_39
Type:
Location: 40578 - 41546 (-)
Gene ID: HRGMv2_1971_4_40
Type: TC
Location: 41632 - 42972 (+)
Gene ID: HRGMv2_1971_4_41
Type: TC
Location: 42974 - 44431 (+)
Gene ID: HRGMv2_1971_4_42
Type: TC
Location: 44524 - 45975 (+)
Gene ID: HRGMv2_1971_4_43
Type: TC
Location: 45972 - 47159 (+)
Gene ID: HRGMv2_1971_4_44
Type: TC
Location: 47197 - 47901 (+)
Gene ID: HRGMv2_1971_4_45
Type: TC
Location: 48023 - 49249 (+)
Gene ID: HRGMv2_1971_4_46
Type:
Location: 49312 - 50040 (-)
Gene ID: HRGMv2_1971_4_47
Type: pfam
Location: 50224 - 50571 (-)
Gene ID: HRGMv2_1971_4_48
Type: TC
Location: 50639 - 51514 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_1971_4_47 vegetarian > omnivore 1.14109 0.00224

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