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Cluster: HRGMv2_1881_CGC8

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_291 309719 311452 - 2.A.36.6.11
peptidase HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_292 311565 312476 - S66.UPW
CAZyme HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_293 312578 313192 + GH23
pfam HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_294 313193 313924 - PilZ | PilZN
TC HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_295 314134 314385 + 1.E.43.1.1
CAZyme HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_296 314437 316140 - GH37
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_297 317110 317601 + NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
pfam HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_298 317625 318131 + T6SS-SciN
TC HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_299 318155 319498 + 3.A.23.1.1
TC HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_300 319516 320754 + 3.A.23.1.1
TC HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_301 320758 324369 + 3.A.23.1.1
pfam HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_302 324388 325098 + TagF_N
pfam HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_303 325110 326126 + ImpA_N
TC HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_304 326201 326725 + 3.A.23.2.1
TC HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_305 326729 328231 + 3.A.23.2.1
pfam HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_306 328287 328712 + Rap1a
pfam HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_307 329185 329667 + T6SS_HCP
CAZyme HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_308 329869 330702 + GH24
Gene ID: HRGMv2_1881_1_291
Type: TC
Location: 309719 - 311452 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_292
Type: peptidase
Location: 311565 - 312476 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_293
Type: CAZyme
Location: 312578 - 313192 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_294
Type: pfam
Location: 313193 - 313924 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_295
Type: TC
Location: 314134 - 314385 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_296
Type: CAZyme
Location: 314437 - 316140 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_297
Type:
Location: 317110 - 317601 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_298
Type: pfam
Location: 317625 - 318131 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_299
Type: TC
Location: 318155 - 319498 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_300
Type: TC
Location: 319516 - 320754 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_301
Type: TC
Location: 320758 - 324369 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_302
Type: pfam
Location: 324388 - 325098 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_303
Type: pfam
Location: 325110 - 326126 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_304
Type: TC
Location: 326201 - 326725 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_305
Type: TC
Location: 326729 - 328231 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_306
Type: pfam
Location: 328287 - 328712 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_307
Type: pfam
Location: 329185 - 329667 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_308
Type: CAZyme
Location: 329869 - 330702 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_1881_1_304 vegetarian > vegan 2.91294 0.02017
HRGMv2_1881_1_307 vegetarian > omnivore 1.22177 0.03699

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