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Cluster: HRGMv2_1881_CGC73

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_1881_41 HRGMv2_1881_41_6 5662 7494 + 4.A.1.2.11
CAZyme HRGMv2_1881_41 HRGMv2_1881_41_7 7506 8978 + GH1
CAZyme HRGMv2_1881_41 HRGMv2_1881_41_8 8988 10379 + GH1
TC HRGMv2_1881_41 HRGMv2_1881_41_9 10908 12338 - 1.I.1.1.3
STP HRGMv2_1881_41 HRGMv2_1881_41_10 12621 13295 + TetR_N
TC HRGMv2_1881_41 HRGMv2_1881_41_11 13295 14290 + 3.A.1.105.15
TC HRGMv2_1881_41 HRGMv2_1881_41_12 14283 16022 + 3.A.1.105.15
TC HRGMv2_1881_41 HRGMv2_1881_41_13 16012 17145 + 3.A.1.105.15
TC HRGMv2_1881_41 HRGMv2_1881_41_14 17155 18261 + 3.A.1.105.15
TC HRGMv2_1881_41 HRGMv2_1881_41_15 18214 18633 - 9.B.15.1.1
pfam HRGMv2_1881_41 HRGMv2_1881_41_16 18767 19528 + Exo_endo_phos
pfam HRGMv2_1881_41 HRGMv2_1881_41_17 19525 20769 + PLDc | PLDc_2 | PLDc_2
TC HRGMv2_1881_41 HRGMv2_1881_41_18 20769 21734 + 4.D.2.4.3
Gene ID: HRGMv2_1881_41_6
Type: TC
Location: 5662 - 7494 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_41_7
Type: CAZyme
Location: 7506 - 8978 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_41_8
Type: CAZyme
Location: 8988 - 10379 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_41_9
Type: TC
Location: 10908 - 12338 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_41_10
Type: STP
Location: 12621 - 13295 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_41_11
Type: TC
Location: 13295 - 14290 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_41_12
Type: TC
Location: 14283 - 16022 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_41_13
Type: TC
Location: 16012 - 17145 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_41_14
Type: TC
Location: 17155 - 18261 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_41_15
Type: TC
Location: 18214 - 18633 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_41_16
Type: pfam
Location: 18767 - 19528 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_41_17
Type: pfam
Location: 19525 - 20769 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_41_18
Type: TC
Location: 20769 - 21734 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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