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Cluster: HRGMv2_1881_CGC66

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_22 23107 24498 - GH1
TC HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_23 24514 26373 - 4.A.1.2.2
pfam HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_24 26490 27380 - PRD | PRD | CAT_RBD
pfam HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_25 27380 28252 - SurE
TC HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_26 28264 29592 - 1.B.25.1.19
pfam HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_27 29921 30859 - Dus
TC HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_28 31091 31489 + 1.E.14.1.4
TC HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_29 31489 32181 + 2.A.122.1.1
pfam HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_30 32311 33192 + dCMP_cyt_deam_1 | dCMP_cyt_deam_2
TC HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_31 33316 34029 + 9.B.114.1.1
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_32 34039 34464 - NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
pfam HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_33 34675 34911 - BssS
TC HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_34 35052 36062 - 3.A.1.2.3
TC HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_35 36078 37598 - 3.A.1.2.3
TC HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_36 37683 38681 - 3.A.1.2.3
TF HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_37 38977 40002 - LacI
TC HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_38 40158 41318 - 9.B.169.1.2
pfam HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_39 41336 42001 - GTP_cyclohydroI
TC HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_40 42127 43254 - 2.A.1.51.4
peptidase HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_41 43404 44240 + S09.A39
TC HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_42 44276 46258 - 1.B.14.1.4
TC HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_43 46527 47996 - 2.A.3.1.2
TC HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_44 48153 48890 - 3.A.1.3.21
TC HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_45 48871 49530 - 3.A.1.3.10
TC HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_46 49527 50192 - 3.A.1.3.6
STP HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_47 50196 50981 - SBP_bac_3
TF HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_48 51136 52002 - HTH_1
TC HRGMv2_1881_25 HRGMv2_1881_25_49 52105 53154 + 2.A.98.1.3
Gene ID: HRGMv2_1881_25_22
Type: CAZyme
Location: 23107 - 24498 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_23
Type: TC
Location: 24514 - 26373 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_24
Type: pfam
Location: 26490 - 27380 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_25
Type: pfam
Location: 27380 - 28252 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_26
Type: TC
Location: 28264 - 29592 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_27
Type: pfam
Location: 29921 - 30859 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_28
Type: TC
Location: 31091 - 31489 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_29
Type: TC
Location: 31489 - 32181 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_30
Type: pfam
Location: 32311 - 33192 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_31
Type: TC
Location: 33316 - 34029 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_32
Type:
Location: 34039 - 34464 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_33
Type: pfam
Location: 34675 - 34911 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_34
Type: TC
Location: 35052 - 36062 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_35
Type: TC
Location: 36078 - 37598 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_36
Type: TC
Location: 37683 - 38681 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_37
Type: TF
Location: 38977 - 40002 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_38
Type: TC
Location: 40158 - 41318 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_39
Type: pfam
Location: 41336 - 42001 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_40
Type: TC
Location: 42127 - 43254 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_41
Type: peptidase
Location: 43404 - 44240 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_42
Type: TC
Location: 44276 - 46258 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_43
Type: TC
Location: 46527 - 47996 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_44
Type: TC
Location: 48153 - 48890 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_45
Type: TC
Location: 48871 - 49530 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_46
Type: TC
Location: 49527 - 50192 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_47
Type: STP
Location: 50196 - 50981 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_48
Type: TF
Location: 51136 - 52002 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_25_49
Type: TC
Location: 52105 - 53154 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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