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Cluster: HRGMv2_1881_CGC6

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_202 222795 223946 + 3.A.6.2.1
TC HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_203 223939 226017 + 3.A.6.2.1
pfam HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_204 226017 226430 + FlhE
TC HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_205 226722 228296 + 2.A.2.5.2
CAZyme HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_206 228307 229446 + GH105
pfam HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_207 229641 231374 - tRNA-synt_1d | Arg_tRNA_synt_N | DALR_1
pfam HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_208 231520 232080 + YecM
TC HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_209 232133 232876 + 9.B.158.1.2
Gene ID: HRGMv2_1881_1_202
Type: TC
Location: 222795 - 223946 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_203
Type: TC
Location: 223939 - 226017 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_204
Type: pfam
Location: 226017 - 226430 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_205
Type: TC
Location: 226722 - 228296 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_206
Type: CAZyme
Location: 228307 - 229446 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_207
Type: pfam
Location: 229641 - 231374 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_208
Type: pfam
Location: 231520 - 232080 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_209
Type: TC
Location: 232133 - 232876 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_1881_1_205 vegetarian > omnivore 3.13455 0.01386
HRGMv2_1881_1_205 vegetarian > vegan 2.04339 0.02017

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