dbCAN Logo

Cluster: HRGMv2_1881_CGC5

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_177 196348 197769 - 2.A.1.3.51
pfam HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_178 198186 198437 + DUF2766
peptidase HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_179 198555 199112 + C56.UNW
TC HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_180 199431 200411 + 3.A.1.2.2
TC HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_181 200482 201996 + 3.A.1.2.2
TC HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_182 202011 202994 + 3.A.1.2.2
pfam HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_183 203180 203986 + Trehalose_PPase
CAZyme HRGMv2_1881_1 HRGMv2_1881_1_184 203961 205385 + GT20
Gene ID: HRGMv2_1881_1_177
Type: TC
Location: 196348 - 197769 (-)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_178
Type: pfam
Location: 198186 - 198437 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_179
Type: peptidase
Location: 198555 - 199112 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_180
Type: TC
Location: 199431 - 200411 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_181
Type: TC
Location: 200482 - 201996 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_182
Type: TC
Location: 202011 - 202994 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_183
Type: pfam
Location: 203180 - 203986 (+)
Gene ID: HRGMv2_1881_1_184
Type: CAZyme
Location: 203961 - 205385 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

Loading chart...

No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

← Back to Cluster List