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Cluster: HRGMv2_1878_CGC37

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_1878_17 HRGMv2_1878_17_26 24705 33470 - 1.C.75.1.2
pfam HRGMv2_1878_17 HRGMv2_1878_17_27 33489 34001 - HlyC
TC HRGMv2_1878_17 HRGMv2_1878_17_28 34004 35695 - 1.B.20.1.5
pfam HRGMv2_1878_17 HRGMv2_1878_17_29 35895 36824 - FdhE_N | FdhE_central | FdhE_C
TC HRGMv2_1878_17 HRGMv2_1878_17_30 36821 37456 - 5.A.3.2.1
TC HRGMv2_1878_17 HRGMv2_1878_17_31 37453 38355 - 5.A.3.2.1
TC HRGMv2_1878_17 HRGMv2_1878_17_32 38368 40782 - 5.A.3.2.1
TC HRGMv2_1878_17 HRGMv2_1878_17_33 40831 41418 - 5.A.3.2.1
pfam HRGMv2_1878_17 HRGMv2_1878_17_34 41858 42688 + FdhD-NarQ
pfam HRGMv2_1878_17 HRGMv2_1878_17_35 42803 43015 + YdgH_BhsA-like
TC HRGMv2_1878_17 HRGMv2_1878_17_36 43057 43380 - 2.A.78.2.3
TC HRGMv2_1878_17 HRGMv2_1878_17_37 43380 44039 - 2.A.78.2.3
TF HRGMv2_1878_17 HRGMv2_1878_17_38 44141 44689 + HTH_3
TF HRGMv2_1878_17 HRGMv2_1878_17_39 44711 45706 + LacI
CAZyme HRGMv2_1878_17 HRGMv2_1878_17_40 45811 47934 + GH36
TC HRGMv2_1878_17 HRGMv2_1878_17_41 47979 49253 + 2.A.1.5.4
pfam HRGMv2_1878_17 HRGMv2_1878_17_42 49241 49555 - rhaM
pfam HRGMv2_1878_17 HRGMv2_1878_17_43 49552 50700 - Fe-ADH | Fe-ADH_2 | ADH_Fe_C
TC HRGMv2_1878_17 HRGMv2_1878_17_44 50874 51881 - 3.A.1.2.8
TC HRGMv2_1878_17 HRGMv2_1878_17_45 51878 52879 - 3.A.1.2.9
TC HRGMv2_1878_17 HRGMv2_1878_17_46 52879 54381 - 3.A.1.2.9
TC HRGMv2_1878_17 HRGMv2_1878_17_47 54430 55416 - 3.A.1.2.9
Gene ID: HRGMv2_1878_17_26
Type: TC
Location: 24705 - 33470 (-)
Gene ID: HRGMv2_1878_17_27
Type: pfam
Location: 33489 - 34001 (-)
Gene ID: HRGMv2_1878_17_28
Type: TC
Location: 34004 - 35695 (-)
Gene ID: HRGMv2_1878_17_29
Type: pfam
Location: 35895 - 36824 (-)
Gene ID: HRGMv2_1878_17_30
Type: TC
Location: 36821 - 37456 (-)
Gene ID: HRGMv2_1878_17_31
Type: TC
Location: 37453 - 38355 (-)
Gene ID: HRGMv2_1878_17_32
Type: TC
Location: 38368 - 40782 (-)
Gene ID: HRGMv2_1878_17_33
Type: TC
Location: 40831 - 41418 (-)
Gene ID: HRGMv2_1878_17_34
Type: pfam
Location: 41858 - 42688 (+)
Gene ID: HRGMv2_1878_17_35
Type: pfam
Location: 42803 - 43015 (+)
Gene ID: HRGMv2_1878_17_36
Type: TC
Location: 43057 - 43380 (-)
Gene ID: HRGMv2_1878_17_37
Type: TC
Location: 43380 - 44039 (-)
Gene ID: HRGMv2_1878_17_38
Type: TF
Location: 44141 - 44689 (+)
Gene ID: HRGMv2_1878_17_39
Type: TF
Location: 44711 - 45706 (+)
Gene ID: HRGMv2_1878_17_40
Type: CAZyme
Location: 45811 - 47934 (+)
Gene ID: HRGMv2_1878_17_41
Type: TC
Location: 47979 - 49253 (+)
Gene ID: HRGMv2_1878_17_42
Type: pfam
Location: 49241 - 49555 (-)
Gene ID: HRGMv2_1878_17_43
Type: pfam
Location: 49552 - 50700 (-)
Gene ID: HRGMv2_1878_17_44
Type: TC
Location: 50874 - 51881 (-)
Gene ID: HRGMv2_1878_17_45
Type: TC
Location: 51878 - 52879 (-)
Gene ID: HRGMv2_1878_17_46
Type: TC
Location: 52879 - 54381 (-)
Gene ID: HRGMv2_1878_17_47
Type: TC
Location: 54430 - 55416 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_1878_17_36 vegetarian > omnivore 1.77284 0.02798
HRGMv2_1878_17_39 vegetarian > omnivore 1.24876 0.02798
HRGMv2_1878_17_39 vegetarian > vegan 1.37798 0.03350
HRGMv2_1878_17_40 vegetarian > omnivore 1.74812 0.02798
HRGMv2_1878_17_41 vegetarian > vegan 1.09252 0.03350
HRGMv2_1878_17_41 vegetarian > omnivore 1.85909 0.02798
HRGMv2_1878_17_42 vegetarian > vegan 1.51569 0.03350
HRGMv2_1878_17_43 vegetarian > vegan 1.09654 0.03350
HRGMv2_1878_17_43 vegetarian > omnivore 1.13960 0.02798
HRGMv2_1878_17_44 vegetarian > vegan 1.11359 0.03350
HRGMv2_1878_17_45 vegetarian > vegan 1.18393 0.03350
HRGMv2_1878_17_45 vegetarian > omnivore 1.25688 0.02798
HRGMv2_1878_17_47 vegetarian > vegan 1.44555 0.03350
HRGMv2_1878_17_47 vegetarian > omnivore 1.78006 0.02798

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