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Cluster: HRGMv2_1878_CGC15

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_1878_5 HRGMv2_1878_5_77 82422 83990 + GH78
TC HRGMv2_1878_5 HRGMv2_1878_5_78 84017 85393 + 2.A.2.3.3
TC HRGMv2_1878_5 HRGMv2_1878_5_79 85414 86976 + 1.B.3.1.2
pfam HRGMv2_1878_5 HRGMv2_1878_5_80 87393 88358 + Epimerase | GDP_Man_Dehyd
TC HRGMv2_1878_5 HRGMv2_1878_5_81 88497 89693 + 2.A.1.2.26
STP HRGMv2_1878_5 HRGMv2_1878_5_82 89710 90468 - LysR_substrate
pfam HRGMv2_1878_5 HRGMv2_1878_5_83 90826 91341 + Acetyltransf_1 | Acetyltransf_3
TC HRGMv2_1878_5 HRGMv2_1878_5_84 91762 92808 - 3.A.1.20.2
TC HRGMv2_1878_5 HRGMv2_1878_5_85 92813 94891 - 3.A.1.20.2
TC HRGMv2_1878_5 HRGMv2_1878_5_86 94965 95996 - 3.A.1.20.2
TC HRGMv2_1878_5 HRGMv2_1878_5_87 96010 97311 - 2.A.1.4.4
TF HRGMv2_1878_5 HRGMv2_1878_5_88 97397 98938 - TF_AP-2
TF HRGMv2_1878_5 HRGMv2_1878_5_89 98938 99567 - GerE
TC HRGMv2_1878_5 HRGMv2_1878_5_90 99837 100799 + 3.A.1.17.1
TC HRGMv2_1878_5 HRGMv2_1878_5_91 100809 101576 + 3.A.1.17.1
TC HRGMv2_1878_5 HRGMv2_1878_5_92 101573 102400 + 3.A.1.17.1
Gene ID: HRGMv2_1878_5_77
Type: CAZyme
Location: 82422 - 83990 (+)
Gene ID: HRGMv2_1878_5_78
Type: TC
Location: 84017 - 85393 (+)
Gene ID: HRGMv2_1878_5_79
Type: TC
Location: 85414 - 86976 (+)
Gene ID: HRGMv2_1878_5_80
Type: pfam
Location: 87393 - 88358 (+)
Gene ID: HRGMv2_1878_5_81
Type: TC
Location: 88497 - 89693 (+)
Gene ID: HRGMv2_1878_5_82
Type: STP
Location: 89710 - 90468 (-)
Gene ID: HRGMv2_1878_5_83
Type: pfam
Location: 90826 - 91341 (+)
Gene ID: HRGMv2_1878_5_84
Type: TC
Location: 91762 - 92808 (-)
Gene ID: HRGMv2_1878_5_85
Type: TC
Location: 92813 - 94891 (-)
Gene ID: HRGMv2_1878_5_86
Type: TC
Location: 94965 - 95996 (-)
Gene ID: HRGMv2_1878_5_87
Type: TC
Location: 96010 - 97311 (-)
Gene ID: HRGMv2_1878_5_88
Type: TF
Location: 97397 - 98938 (-)
Gene ID: HRGMv2_1878_5_89
Type: TF
Location: 98938 - 99567 (-)
Gene ID: HRGMv2_1878_5_90
Type: TC
Location: 99837 - 100799 (+)
Gene ID: HRGMv2_1878_5_91
Type: TC
Location: 100809 - 101576 (+)
Gene ID: HRGMv2_1878_5_92
Type: TC
Location: 101573 - 102400 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_1878_5_84 vegetarian > omnivore 1.14024 0.02798
HRGMv2_1878_5_84 vegetarian > vegan 1.20385 0.03350
HRGMv2_1878_5_86 vegetarian > omnivore 1.68921 0.02798
HRGMv2_1878_5_86 vegetarian > vegan 1.19855 0.03350
HRGMv2_1878_5_91 vegetarian > omnivore 1.23925 0.02798

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