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Cluster: HRGMv2_1821_CGC9

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_189 200670 203042 + GH20
TF HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_190 203076 204077 - LacI
TC HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_191 204268 206541 + 5.A.3.4.1
pfam HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_192 206821 208560 + Transpeptidase | PBP_dimer
TC HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_193 208982 210193 + 8.A.1.6.2
TC HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_194 210190 213423 + 2.A.6.2.39
TC HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_195 213420 216521 + 2.A.6.2.12
TC HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_196 216525 217913 + 2.A.6.2.39
TC HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_197 218004 220154 + 4.C.1.1.16
TC HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_198 220151 221341 + 2.A.1.42.1
Gene ID: HRGMv2_1821_2_189
Type: CAZyme
Location: 200670 - 203042 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_190
Type: TF
Location: 203076 - 204077 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_191
Type: TC
Location: 204268 - 206541 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_192
Type: pfam
Location: 206821 - 208560 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_193
Type: TC
Location: 208982 - 210193 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_194
Type: TC
Location: 210190 - 213423 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_195
Type: TC
Location: 213420 - 216521 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_196
Type: TC
Location: 216525 - 217913 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_197
Type: TC
Location: 218004 - 220154 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_198
Type: TC
Location: 220151 - 221341 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

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