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Cluster: HRGMv2_1821_CGC8

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_121 133015 133734 + GT51
STP HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_122 133738 134010 - PTS-HPr
pfam HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_123 134007 134861 - RapZ-like_N | PapZ_C
TC HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_124 134909 135388 - 4.A.2.1.7
pfam HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_125 135541 135828 - Ribosomal_S30AE
pfam HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_126 135850 137283 - Sigma54_AID | Sigma54_DBD | Sigma54_CBD
TC HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_127 137332 138057 - 1.B.42.1.2
TC HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_128 138063 138614 - 1.B.42.1.2
TC HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_129 138589 139161 - 1.B.42.1.2
pfam HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_130 139158 139724 - Hydrolase_3
STP HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_131 139738 140721 - CBS | CBS | SIS
TC HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_132 140738 141718 - 2.A.19.5.1
TC HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_133 141946 142761 + 3.A.1.27.3
TC HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_134 142766 143548 + 3.A.1.27.3
TC HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_135 143553 144098 + 3.A.1.27.3
TC HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_136 144114 144749 + 3.A.1.27.3
TC HRGMv2_1821_2 HRGMv2_1821_2_137 144749 145054 + 3.A.1.27.3
Gene ID: HRGMv2_1821_2_121
Type: CAZyme
Location: 133015 - 133734 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_122
Type: STP
Location: 133738 - 134010 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_123
Type: pfam
Location: 134007 - 134861 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_124
Type: TC
Location: 134909 - 135388 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_125
Type: pfam
Location: 135541 - 135828 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_126
Type: pfam
Location: 135850 - 137283 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_127
Type: TC
Location: 137332 - 138057 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_128
Type: TC
Location: 138063 - 138614 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_129
Type: TC
Location: 138589 - 139161 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_130
Type: pfam
Location: 139158 - 139724 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_131
Type: STP
Location: 139738 - 140721 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_132
Type: TC
Location: 140738 - 141718 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_133
Type: TC
Location: 141946 - 142761 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_134
Type: TC
Location: 142766 - 143548 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_135
Type: TC
Location: 143553 - 144098 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_136
Type: TC
Location: 144114 - 144749 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_2_137
Type: TC
Location: 144749 - 145054 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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