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Cluster: HRGMv2_1821_CGC46

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_1821_42 HRGMv2_1821_42_11 10351 12270 - GH23
TC HRGMv2_1821_42 HRGMv2_1821_42_12 12540 14336 + 3.A.9.1.1
sulfatase HRGMv2_1821_42 HRGMv2_1821_42_13 14339 17956 + S1_37
TF HRGMv2_1821_42 HRGMv2_1821_42_14 17966 18667 + GntR
TC HRGMv2_1821_42 HRGMv2_1821_42_15 18693 19964 + 3.A.1.4.4
TC HRGMv2_1821_42 HRGMv2_1821_42_16 20057 21622 + 3.A.1.4.4
TC HRGMv2_1821_42 HRGMv2_1821_42_17 21622 22695 + 3.A.1.4.4
TC HRGMv2_1821_42 HRGMv2_1821_42_18 22692 23483 + 3.A.1.4.4
TC HRGMv2_1821_42 HRGMv2_1821_42_19 23485 24183 + 3.A.1.4.4
pfam HRGMv2_1821_42 HRGMv2_1821_42_20 24191 25204 - DUF4432
TC HRGMv2_1821_42 HRGMv2_1821_42_21 25201 26526 - 2.A.1.7.5
STP HRGMv2_1821_42 HRGMv2_1821_42_22 26536 27453 - PfkB
TF HRGMv2_1821_42 HRGMv2_1821_42_23 27840 28610 + HTH_DeoR
TC HRGMv2_1821_42 HRGMv2_1821_42_24 28802 30469 + 3.A.1.120.6
Gene ID: HRGMv2_1821_42_11
Type: CAZyme
Location: 10351 - 12270 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_42_12
Type: TC
Location: 12540 - 14336 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_42_13
Type: sulfatase
Location: 14339 - 17956 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_42_14
Type: TF
Location: 17966 - 18667 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_42_15
Type: TC
Location: 18693 - 19964 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_42_16
Type: TC
Location: 20057 - 21622 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_42_17
Type: TC
Location: 21622 - 22695 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_42_18
Type: TC
Location: 22692 - 23483 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_42_19
Type: TC
Location: 23485 - 24183 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_42_20
Type: pfam
Location: 24191 - 25204 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_42_21
Type: TC
Location: 25201 - 26526 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_42_22
Type: STP
Location: 26536 - 27453 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_42_23
Type: TF
Location: 27840 - 28610 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_42_24
Type: TC
Location: 28802 - 30469 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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