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Cluster: HRGMv2_1821_CGC44

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_1821_35 HRGMv2_1821_35_11 10875 11339 + GH23
peptidase HRGMv2_1821_35 HRGMv2_1821_35_12 11360 12013 + A24.UPA
pfam HRGMv2_1821_35 HRGMv2_1821_35_13 12013 13407 + Shufflon_N | Shufflon_N
TC HRGMv2_1821_35 HRGMv2_1821_35_14 13530 14027 + 3.A.7.10.1
TC HRGMv2_1821_35 HRGMv2_1821_35_15 14024 14848 + 3.A.7.10.1
TC HRGMv2_1821_35 HRGMv2_1821_35_16 14848 16005 + 3.A.7.10.1
NULL(UNKNOWN) HRGMv2_1821_35 HRGMv2_1821_35_17 16002 16292 + NULL(UNKNOWN)
[View Structural Homologs]
STP HRGMv2_1821_35 HRGMv2_1821_35_18 16324 21273 + HTH_7
TC HRGMv2_1821_35 HRGMv2_1821_35_19 21296 21643 + 3.A.7.10.1
TC HRGMv2_1821_35 HRGMv2_1821_35_20 21654 22346 + 3.A.7.10.1
TC HRGMv2_1821_35 HRGMv2_1821_35_21 22356 23276 + 3.A.7.10.1
Gene ID: HRGMv2_1821_35_11
Type: CAZyme
Location: 10875 - 11339 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_35_12
Type: peptidase
Location: 11360 - 12013 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_35_13
Type: pfam
Location: 12013 - 13407 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_35_14
Type: TC
Location: 13530 - 14027 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_35_15
Type: TC
Location: 14024 - 14848 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_35_16
Type: TC
Location: 14848 - 16005 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_35_17
Type:
Location: 16002 - 16292 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_35_18
Type: STP
Location: 16324 - 21273 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_35_19
Type: TC
Location: 21296 - 21643 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_35_20
Type: TC
Location: 21654 - 22346 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_35_21
Type: TC
Location: 22356 - 23276 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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