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Cluster: HRGMv2_1821_CGC4

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_187 208247 209446 - 3.A.15.2.1
TC HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_188 209439 210824 - 3.A.15.2.1
TC HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_189 210811 211266 - 3.A.15.2.1
pfam HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_190 211441 212337 - QRPTase_C | QRPTase_N
pfam HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_191 212535 213077 + Amidase_2
TC HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_192 213103 213957 + 9.B.125.1.1
CAZyme HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_193 213939 214898 - GH43_26
TC HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_194 214895 216307 - 2.A.2.3.4
TC HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_195 216506 217861 - 2.A.3.1.3
Gene ID: HRGMv2_1821_1_187
Type: TC
Location: 208247 - 209446 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_188
Type: TC
Location: 209439 - 210824 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_189
Type: TC
Location: 210811 - 211266 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_190
Type: pfam
Location: 211441 - 212337 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_191
Type: pfam
Location: 212535 - 213077 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_192
Type: TC
Location: 213103 - 213957 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_193
Type: CAZyme
Location: 213939 - 214898 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_194
Type: TC
Location: 214895 - 216307 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_195
Type: TC
Location: 216506 - 217861 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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