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Cluster: HRGMv2_1821_CGC1

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_39 38940 39647 + 1.A.14.2.2
TC HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_40 39699 40664 - 4.D.2.4.3
pfam HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_41 40664 41908 - PLDc | PLDc_2 | PLDc_2
pfam HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_42 41905 42666 - Exo_endo_phos
TC HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_43 42846 43238 + 9.B.15.1.1
TC HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_44 43456 44835 + 1.I.1.1.3
pfam HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_45 44838 45788 + Dus
TC HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_46 45859 47046 + 2.A.1.46.7
TC HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_47 47069 48670 - 2.A.20.1.1
peptidase HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_48 48858 49979 - C82.A04
CAZyme HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_49 50194 52008 - GH15
TC HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_50 52240 52821 - 9.B.27.2.7
TC HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_51 53027 53614 + 9.B.29.3.1
peptidase HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_52 53793 54740 + S11.002
TC HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_53 54967 57414 + 1.A.23.1.2
CAZyme HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_54 57725 60376 - GH20
TC HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_55 60425 61828 - 1.B.25.1.13
pfam HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_56 62112 63815 - FAD_binding_4 | Lact-deh-memb
CAZyme HRGMv2_1821_1 HRGMv2_1821_1_57 63971 66268 + GH3
Gene ID: HRGMv2_1821_1_39
Type: TC
Location: 38940 - 39647 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_40
Type: TC
Location: 39699 - 40664 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_41
Type: pfam
Location: 40664 - 41908 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_42
Type: pfam
Location: 41905 - 42666 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_43
Type: TC
Location: 42846 - 43238 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_44
Type: TC
Location: 43456 - 44835 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_45
Type: pfam
Location: 44838 - 45788 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_46
Type: TC
Location: 45859 - 47046 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_47
Type: TC
Location: 47069 - 48670 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_48
Type: peptidase
Location: 48858 - 49979 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_49
Type: CAZyme
Location: 50194 - 52008 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_50
Type: TC
Location: 52240 - 52821 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_51
Type: TC
Location: 53027 - 53614 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_52
Type: peptidase
Location: 53793 - 54740 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_53
Type: TC
Location: 54967 - 57414 (+)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_54
Type: CAZyme
Location: 57725 - 60376 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_55
Type: TC
Location: 60425 - 61828 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_56
Type: pfam
Location: 62112 - 63815 (-)
Gene ID: HRGMv2_1821_1_57
Type: CAZyme
Location: 63971 - 66268 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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