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Cluster: HRGMv2_1802_CGC13

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
CAZyme HRGMv2_1802_11 HRGMv2_1802_11_63 51089 51868 - GT73
TC HRGMv2_1802_11 HRGMv2_1802_11_64 52297 54384 - 1.B.14.1.13
TC HRGMv2_1802_11 HRGMv2_1802_11_65 54815 56401 + 3.A.1.5.33
TC HRGMv2_1802_11 HRGMv2_1802_11_66 56401 57375 + 3.A.1.5.11
TC HRGMv2_1802_11 HRGMv2_1802_11_67 57365 58177 + 3.A.1.5.2
TC HRGMv2_1802_11 HRGMv2_1802_11_68 58171 58965 + 3.A.1.5.20
TC HRGMv2_1802_11 HRGMv2_1802_11_69 58949 59539 + 3.A.1.5.24
TC HRGMv2_1802_11 HRGMv2_1802_11_70 59624 60274 + 3.A.1.15.3
TC HRGMv2_1802_11 HRGMv2_1802_11_71 60414 61052 + 2.A.76.1.5
pfam HRGMv2_1802_11 HRGMv2_1802_11_72 61227 61589 + DUF1971
pfam HRGMv2_1802_11 HRGMv2_1802_11_73 61593 61775 + DUF1869
TC HRGMv2_1802_11 HRGMv2_1802_11_74 61956 62636 + 9.B.2.5.3
TC HRGMv2_1802_11 HRGMv2_1802_11_75 62688 64835 - 3.D.1.9.2
TC HRGMv2_1802_11 HRGMv2_1802_11_76 65197 65445 + 1.E.43.1.1
TC HRGMv2_1802_11 HRGMv2_1802_11_77 65716 66741 - 9.B.34.1.4
Gene ID: HRGMv2_1802_11_63
Type: CAZyme
Location: 51089 - 51868 (-)
Gene ID: HRGMv2_1802_11_64
Type: TC
Location: 52297 - 54384 (-)
Gene ID: HRGMv2_1802_11_65
Type: TC
Location: 54815 - 56401 (+)
Gene ID: HRGMv2_1802_11_66
Type: TC
Location: 56401 - 57375 (+)
Gene ID: HRGMv2_1802_11_67
Type: TC
Location: 57365 - 58177 (+)
Gene ID: HRGMv2_1802_11_68
Type: TC
Location: 58171 - 58965 (+)
Gene ID: HRGMv2_1802_11_69
Type: TC
Location: 58949 - 59539 (+)
Gene ID: HRGMv2_1802_11_70
Type: TC
Location: 59624 - 60274 (+)
Gene ID: HRGMv2_1802_11_71
Type: TC
Location: 60414 - 61052 (+)
Gene ID: HRGMv2_1802_11_72
Type: pfam
Location: 61227 - 61589 (+)
Gene ID: HRGMv2_1802_11_73
Type: pfam
Location: 61593 - 61775 (+)
Gene ID: HRGMv2_1802_11_74
Type: TC
Location: 61956 - 62636 (+)
Gene ID: HRGMv2_1802_11_75
Type: TC
Location: 62688 - 64835 (-)
Gene ID: HRGMv2_1802_11_76
Type: TC
Location: 65197 - 65445 (+)
Gene ID: HRGMv2_1802_11_77
Type: TC
Location: 65716 - 66741 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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