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Cluster: HRGMv2_1784_CGC3

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_1784_2 HRGMv2_1784_2_144 162122 163057 + 3.A.1.2.11
pfam HRGMv2_1784_2 HRGMv2_1784_2_145 163101 163721 + DUF2291
TC HRGMv2_1784_2 HRGMv2_1784_2_146 163723 165267 + 3.A.1.2.11
TC HRGMv2_1784_2 HRGMv2_1784_2_147 165285 166352 + 3.A.1.2.11
pfam HRGMv2_1784_2 HRGMv2_1784_2_148 166417 167214 + adh_short | KR | adh_short_C2 | SDR
pfam HRGMv2_1784_2 HRGMv2_1784_2_149 167250 168035 + adh_short | KR | adh_short_C2
TC HRGMv2_1784_2 HRGMv2_1784_2_150 168111 170144 - 2.A.15.1.4
STP HRGMv2_1784_2 HRGMv2_1784_2_151 170273 170866 + TetR_N
sulfatase HRGMv2_1784_2 HRGMv2_1784_2_152 170878 172350 + S1_6
CAZyme HRGMv2_1784_2 HRGMv2_1784_2_153 172365 174047 + AA3_2
pfam HRGMv2_1784_2 HRGMv2_1784_2_154 174665 175360 - Acetyltransf_1 | Acetyltransf_3
TC HRGMv2_1784_2 HRGMv2_1784_2_155 175573 177141 + 3.A.1.5.3
TC HRGMv2_1784_2 HRGMv2_1784_2_156 177243 178256 + 3.A.1.5.39
TC HRGMv2_1784_2 HRGMv2_1784_2_157 178256 179089 + 3.A.1.5.38
TC HRGMv2_1784_2 HRGMv2_1784_2_158 179082 179918 + 3.A.1.5.27
TC HRGMv2_1784_2 HRGMv2_1784_2_159 179905 180612 + 3.A.1.5.34
pfam HRGMv2_1784_2 HRGMv2_1784_2_160 180812 182149 - Aminotran_3
pfam HRGMv2_1784_2 HRGMv2_1784_2_161 182330 183094 + adh_short | KR | adh_short_C2
TC HRGMv2_1784_2 HRGMv2_1784_2_162 183854 184615 - 3.A.1.3.5
TC HRGMv2_1784_2 HRGMv2_1784_2_163 184608 185273 - 3.A.1.3.29
TC HRGMv2_1784_2 HRGMv2_1784_2_164 185288 185929 - 3.A.1.3.10
Gene ID: HRGMv2_1784_2_144
Type: TC
Location: 162122 - 163057 (+)
Gene ID: HRGMv2_1784_2_145
Type: pfam
Location: 163101 - 163721 (+)
Gene ID: HRGMv2_1784_2_146
Type: TC
Location: 163723 - 165267 (+)
Gene ID: HRGMv2_1784_2_147
Type: TC
Location: 165285 - 166352 (+)
Gene ID: HRGMv2_1784_2_148
Type: pfam
Location: 166417 - 167214 (+)
Gene ID: HRGMv2_1784_2_149
Type: pfam
Location: 167250 - 168035 (+)
Gene ID: HRGMv2_1784_2_150
Type: TC
Location: 168111 - 170144 (-)
Gene ID: HRGMv2_1784_2_151
Type: STP
Location: 170273 - 170866 (+)
Gene ID: HRGMv2_1784_2_152
Type: sulfatase
Location: 170878 - 172350 (+)
Gene ID: HRGMv2_1784_2_153
Type: CAZyme
Location: 172365 - 174047 (+)
Gene ID: HRGMv2_1784_2_154
Type: pfam
Location: 174665 - 175360 (-)
Gene ID: HRGMv2_1784_2_155
Type: TC
Location: 175573 - 177141 (+)
Gene ID: HRGMv2_1784_2_156
Type: TC
Location: 177243 - 178256 (+)
Gene ID: HRGMv2_1784_2_157
Type: TC
Location: 178256 - 179089 (+)
Gene ID: HRGMv2_1784_2_158
Type: TC
Location: 179082 - 179918 (+)
Gene ID: HRGMv2_1784_2_159
Type: TC
Location: 179905 - 180612 (+)
Gene ID: HRGMv2_1784_2_160
Type: pfam
Location: 180812 - 182149 (-)
Gene ID: HRGMv2_1784_2_161
Type: pfam
Location: 182330 - 183094 (+)
Gene ID: HRGMv2_1784_2_162
Type: TC
Location: 183854 - 184615 (-)
Gene ID: HRGMv2_1784_2_163
Type: TC
Location: 184608 - 185273 (-)
Gene ID: HRGMv2_1784_2_164
Type: TC
Location: 185288 - 185929 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_1784_2_151 vegan > omnivore 1.18491 0.01385
HRGMv2_1784_2_156 vegan > omnivore 1.88726 0.03428
HRGMv2_1784_2_156 vegetarian > omnivore 1.76546 0.03840
HRGMv2_1784_2_157 vegetarian > omnivore 1.98419 0.03840
HRGMv2_1784_2_157 vegetarian > vegan 1.48803 0.04869

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