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Cluster: HRGMv2_1781_CGC70

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_1781_17 HRGMv2_1781_17_92 91102 92526 - 2.A.1.3.51
pfam HRGMv2_1781_17 HRGMv2_1781_17_93 92898 93149 + DUF2766
TC HRGMv2_1781_17 HRGMv2_1781_17_94 93196 94758 - 2.A.2.5.1
pfam HRGMv2_1781_17 HRGMv2_1781_17_95 95011 95514 - Ferritin
peptidase HRGMv2_1781_17 HRGMv2_1781_17_96 96053 96625 + C56.UNW
TC HRGMv2_1781_17 HRGMv2_1781_17_97 96899 97879 + 3.A.1.2.2
TC HRGMv2_1781_17 HRGMv2_1781_17_98 97941 99455 + 3.A.1.2.2
TC HRGMv2_1781_17 HRGMv2_1781_17_99 99470 100450 + 3.A.1.2.2
pfam HRGMv2_1781_17 HRGMv2_1781_17_100 100610 101413 + Trehalose_PPase
CAZyme HRGMv2_1781_17 HRGMv2_1781_17_101 101388 102812 + GT20
pfam HRGMv2_1781_17 HRGMv2_1781_17_102 102841 103269 - Usp
TC HRGMv2_1781_17 HRGMv2_1781_17_103 103632 105215 + 2.A.2.5.2
CAZyme HRGMv2_1781_17 HRGMv2_1781_17_104 105220 106359 + GH105
pfam HRGMv2_1781_17 HRGMv2_1781_17_105 106480 108213 - tRNA-synt_1d | Arg_tRNA_synt_N | DALR_1
pfam HRGMv2_1781_17 HRGMv2_1781_17_106 108444 109013 + YecM
TC HRGMv2_1781_17 HRGMv2_1781_17_107 109089 109823 + 9.B.158.1.2
Gene ID: HRGMv2_1781_17_92
Type: TC
Location: 91102 - 92526 (-)
Gene ID: HRGMv2_1781_17_93
Type: pfam
Location: 92898 - 93149 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_17_94
Type: TC
Location: 93196 - 94758 (-)
Gene ID: HRGMv2_1781_17_95
Type: pfam
Location: 95011 - 95514 (-)
Gene ID: HRGMv2_1781_17_96
Type: peptidase
Location: 96053 - 96625 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_17_97
Type: TC
Location: 96899 - 97879 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_17_98
Type: TC
Location: 97941 - 99455 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_17_99
Type: TC
Location: 99470 - 100450 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_17_100
Type: pfam
Location: 100610 - 101413 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_17_101
Type: CAZyme
Location: 101388 - 102812 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_17_102
Type: pfam
Location: 102841 - 103269 (-)
Gene ID: HRGMv2_1781_17_103
Type: TC
Location: 103632 - 105215 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_17_104
Type: CAZyme
Location: 105220 - 106359 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_17_105
Type: pfam
Location: 106480 - 108213 (-)
Gene ID: HRGMv2_1781_17_106
Type: pfam
Location: 108444 - 109013 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_17_107
Type: TC
Location: 109089 - 109823 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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Differentially Abundant Genes

Gene ID Condition Pair log2FC FDR P-value
HRGMv2_1781_17_103 vegetarian > omnivore 3.10399 0.00744
HRGMv2_1781_17_104 vegetarian > omnivore 1.45303 0.04116

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