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Cluster: HRGMv2_1781_CGC14

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_1781_2 HRGMv2_1781_2_82 62824 64416 + 4.A.1.1.3
STP HRGMv2_1781_2 HRGMv2_1781_2_83 64450 65643 + Aminotran_1_2
pfam HRGMv2_1781_2 HRGMv2_1781_2_84 65959 66162 + YdfZ
TC HRGMv2_1781_2 HRGMv2_1781_2_85 66350 67561 + 9.B.102.1.1
pfam HRGMv2_1781_2 HRGMv2_1781_2_86 67558 67791 + TusA
TC HRGMv2_1781_2 HRGMv2_1781_2_87 67869 68681 - 3.A.1.24.1
pfam HRGMv2_1781_2 HRGMv2_1781_2_88 68954 69955 + A_deaminase
CAZyme HRGMv2_1781_2 HRGMv2_1781_2_89 70012 71052 - GH109
CAZyme HRGMv2_1781_2 HRGMv2_1781_2_90 71483 72853 + GH1
TF HRGMv2_1781_2 HRGMv2_1781_2_91 73074 73289 + HHA
pfam HRGMv2_1781_2 HRGMv2_1781_2_92 73369 73809 + DUF2569
TC HRGMv2_1781_2 HRGMv2_1781_2_93 73887 74468 + 3.D.6.1.4
TC HRGMv2_1781_2 HRGMv2_1781_2_94 74468 75046 + 3.D.6.1.4
TC HRGMv2_1781_2 HRGMv2_1781_2_95 75039 77099 + 3.D.6.1.4
TC HRGMv2_1781_2 HRGMv2_1781_2_96 77100 78152 + 3.D.6.1.4
TC HRGMv2_1781_2 HRGMv2_1781_2_97 78163 78783 + 3.D.6.1.4
TC HRGMv2_1781_2 HRGMv2_1781_2_98 78787 79485 + 3.D.6.1.4
STP HRGMv2_1781_2 HRGMv2_1781_2_99 79487 80122 + HhH-GPD
TC HRGMv2_1781_2 HRGMv2_1781_2_100 80563 82224 + 2.A.17.1.2
Gene ID: HRGMv2_1781_2_82
Type: TC
Location: 62824 - 64416 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_2_83
Type: STP
Location: 64450 - 65643 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_2_84
Type: pfam
Location: 65959 - 66162 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_2_85
Type: TC
Location: 66350 - 67561 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_2_86
Type: pfam
Location: 67558 - 67791 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_2_87
Type: TC
Location: 67869 - 68681 (-)
Gene ID: HRGMv2_1781_2_88
Type: pfam
Location: 68954 - 69955 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_2_89
Type: CAZyme
Location: 70012 - 71052 (-)
Gene ID: HRGMv2_1781_2_90
Type: CAZyme
Location: 71483 - 72853 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_2_91
Type: TF
Location: 73074 - 73289 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_2_92
Type: pfam
Location: 73369 - 73809 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_2_93
Type: TC
Location: 73887 - 74468 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_2_94
Type: TC
Location: 74468 - 75046 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_2_95
Type: TC
Location: 75039 - 77099 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_2_96
Type: TC
Location: 77100 - 78152 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_2_97
Type: TC
Location: 78163 - 78783 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_2_98
Type: TC
Location: 78787 - 79485 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_2_99
Type: STP
Location: 79487 - 80122 (+)
Gene ID: HRGMv2_1781_2_100
Type: TC
Location: 80563 - 82224 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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