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Cluster: HRGMv2_1731_CGC5

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_1731_1 HRGMv2_1731_1_497 574061 574768 + 1.A.30.1.1
STP HRGMv2_1731_1 HRGMv2_1731_1_498 575138 575746 + SKI
CAZyme HRGMv2_1731_1 HRGMv2_1731_1_499 575739 576809 + GT2
pfam HRGMv2_1731_1 HRGMv2_1731_1_500 577153 577572 + ATP-synt_B
pfam HRGMv2_1731_1 HRGMv2_1731_1_501 577673 578254 + ATP-synt_B
TC HRGMv2_1731_1 HRGMv2_1731_1_502 578251 578802 + 3.A.2.1.2
TC HRGMv2_1731_1 HRGMv2_1731_1_503 578806 580314 + 3.A.2.1.2
TC HRGMv2_1731_1 HRGMv2_1731_1_504 580341 581225 + 3.A.2.1.7
TC HRGMv2_1731_1 HRGMv2_1731_1_505 581237 582658 + 3.A.2.1.3
TC HRGMv2_1731_1 HRGMv2_1731_1_506 582743 583147 + 3.A.2.1.1
TC HRGMv2_1731_1 HRGMv2_1731_1_507 583383 583697 - 2.A.7.1.10
Gene ID: HRGMv2_1731_1_497
Type: TC
Location: 574061 - 574768 (+)
Gene ID: HRGMv2_1731_1_498
Type: STP
Location: 575138 - 575746 (+)
Gene ID: HRGMv2_1731_1_499
Type: CAZyme
Location: 575739 - 576809 (+)
Gene ID: HRGMv2_1731_1_500
Type: pfam
Location: 577153 - 577572 (+)
Gene ID: HRGMv2_1731_1_501
Type: pfam
Location: 577673 - 578254 (+)
Gene ID: HRGMv2_1731_1_502
Type: TC
Location: 578251 - 578802 (+)
Gene ID: HRGMv2_1731_1_503
Type: TC
Location: 578806 - 580314 (+)
Gene ID: HRGMv2_1731_1_504
Type: TC
Location: 580341 - 581225 (+)
Gene ID: HRGMv2_1731_1_505
Type: TC
Location: 581237 - 582658 (+)
Gene ID: HRGMv2_1731_1_506
Type: TC
Location: 582743 - 583147 (+)
Gene ID: HRGMv2_1731_1_507
Type: TC
Location: 583383 - 583697 (-)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

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