dbCAN Logo

Cluster: HRGMv2_1731_CGC1

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_1731_1 HRGMv2_1731_1_61 60533 62689 + 3.A.3.32.3
pfam HRGMv2_1731_1 HRGMv2_1731_1_62 62667 62954 + HMA_2
STP HRGMv2_1731_1 HRGMv2_1731_1_63 63208 64371 - Aminotran_1_2
CAZyme HRGMv2_1731_1 HRGMv2_1731_1_64 64431 65591 - GT9
TC HRGMv2_1731_1 HRGMv2_1731_1_65 65591 66991 - 9.B.18.1.2
TC HRGMv2_1731_1 HRGMv2_1731_1_66 67362 68105 + 3.A.1.3.10
TC HRGMv2_1731_1 HRGMv2_1731_1_67 68196 68888 + 3.A.1.3.23
TC HRGMv2_1731_1 HRGMv2_1731_1_68 68892 69650 + 3.A.1.3.24
TC HRGMv2_1731_1 HRGMv2_1731_1_69 69652 70320 + 3.A.1.3.2
TC HRGMv2_1731_1 HRGMv2_1731_1_70 70553 73651 + 9.B.34.1.3
Gene ID: HRGMv2_1731_1_61
Type: TC
Location: 60533 - 62689 (+)
Gene ID: HRGMv2_1731_1_62
Type: pfam
Location: 62667 - 62954 (+)
Gene ID: HRGMv2_1731_1_63
Type: STP
Location: 63208 - 64371 (-)
Gene ID: HRGMv2_1731_1_64
Type: CAZyme
Location: 64431 - 65591 (-)
Gene ID: HRGMv2_1731_1_65
Type: TC
Location: 65591 - 66991 (-)
Gene ID: HRGMv2_1731_1_66
Type: TC
Location: 67362 - 68105 (+)
Gene ID: HRGMv2_1731_1_67
Type: TC
Location: 68196 - 68888 (+)
Gene ID: HRGMv2_1731_1_68
Type: TC
Location: 68892 - 69650 (+)
Gene ID: HRGMv2_1731_1_69
Type: TC
Location: 69652 - 70320 (+)
Gene ID: HRGMv2_1731_1_70
Type: TC
Location: 70553 - 73651 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

Loading chart...

No differentially abundant genes found in the 2019 study.

🧭 Explore Read Mapping of CGC

← Back to Cluster List