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Cluster: HRGMv2_1601_CGC1

🧬 Cluster Details

Gene Type Contig ID Protein ID Start Stop Direction Protein Family
TC HRGMv2_1601_1 HRGMv2_1601_1_32 35041 35484 + 4.A.6.1.16
pfam HRGMv2_1601_1 HRGMv2_1601_1_33 35484 35765 + YajC
TC HRGMv2_1601_1 HRGMv2_1601_1_34 35802 36284 + 4.A.6.1.4
TC HRGMv2_1601_1 HRGMv2_1601_1_35 36375 37175 + 4.A.6.1.4
TC HRGMv2_1601_1 HRGMv2_1601_1_36 37165 38247 + 4.A.6.1.4
TF HRGMv2_1601_1 HRGMv2_1601_1_37 38433 39164 + GntR
STP HRGMv2_1601_1 HRGMv2_1601_1_38 39279 40445 + SIS | SIS
CAZyme HRGMv2_1601_1 HRGMv2_1601_1_39 40563 41732 + CE9
Gene ID: HRGMv2_1601_1_32
Type: TC
Location: 35041 - 35484 (+)
Gene ID: HRGMv2_1601_1_33
Type: pfam
Location: 35484 - 35765 (+)
Gene ID: HRGMv2_1601_1_34
Type: TC
Location: 35802 - 36284 (+)
Gene ID: HRGMv2_1601_1_35
Type: TC
Location: 36375 - 37175 (+)
Gene ID: HRGMv2_1601_1_36
Type: TC
Location: 37165 - 38247 (+)
Gene ID: HRGMv2_1601_1_37
Type: TF
Location: 38433 - 39164 (+)
Gene ID: HRGMv2_1601_1_38
Type: STP
Location: 39279 - 40445 (+)
Gene ID: HRGMv2_1601_1_39
Type: CAZyme
Location: 40563 - 41732 (+)

Taxonomic Lineage

Gene Level Read Mapping

  • Diet (De Filippis et al., 2019)
  • Diet (Huang et al., 2024)
  • IBD (Lloyd-Price et al., 2019)

Gene level read mapping in Diet Intervention Studies (De Filippis et al., 2019)

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No differentially abundant genes found in the 2019 study.

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